61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3702 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  57.91 
 
 
924 aa  1114    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  73.7 
 
 
917 aa  1456    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  44.68 
 
 
911 aa  805    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
922 aa  1906    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  40.8 
 
 
1171 aa  356  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  47.13 
 
 
1068 aa  321  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  43.94 
 
 
1013 aa  314  4.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  40.27 
 
 
1182 aa  313  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  46.11 
 
 
1066 aa  306  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  42.45 
 
 
1046 aa  306  9.000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  47.03 
 
 
1063 aa  305  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  43.53 
 
 
1074 aa  290  8e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  40.84 
 
 
1074 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  44.1 
 
 
1091 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  43.8 
 
 
1067 aa  279  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  40.05 
 
 
772 aa  277  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  39.53 
 
 
765 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  40.06 
 
 
776 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  36.43 
 
 
888 aa  222  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  36.19 
 
 
883 aa  217  8e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  36.94 
 
 
1129 aa  207  5e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  31.27 
 
 
805 aa  207  8e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  34.07 
 
 
963 aa  201  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  40.32 
 
 
792 aa  201  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  31.71 
 
 
1097 aa  197  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  31.2 
 
 
922 aa  197  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  42.68 
 
 
782 aa  194  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  28.88 
 
 
984 aa  178  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.53 
 
 
841 aa  120  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  28.45 
 
 
785 aa  117  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  28.08 
 
 
768 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  25.31 
 
 
833 aa  86.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  27.78 
 
 
759 aa  85.5  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  25.55 
 
 
626 aa  85.1  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.13 
 
 
1737 aa  84  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  24.31 
 
 
893 aa  78.2  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  24.89 
 
 
998 aa  72  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  23.92 
 
 
725 aa  69.3  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  33.33 
 
 
468 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  37.78 
 
 
124 aa  65.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  23.88 
 
 
565 aa  62.4  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  28.57 
 
 
147 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  23.05 
 
 
1178 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  34.21 
 
 
503 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  38.2 
 
 
465 aa  57.8  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  30.08 
 
 
724 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  26 
 
 
756 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  30.85 
 
 
646 aa  55.8  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  32.17 
 
 
716 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  30.39 
 
 
729 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  32.14 
 
 
131 aa  52.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0348  hypothetical protein  30.08 
 
 
131 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  31.3 
 
 
507 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  36.67 
 
 
299 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  27.52 
 
 
132 aa  48.9  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  31.52 
 
 
135 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  48.5  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  31.2 
 
 
562 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
651 aa  46.6  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  26.85 
 
 
136 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  26.19 
 
 
646 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>