291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2422 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2422  YceI family protein  100 
 
 		 202 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3177  YceI family protein  53.27 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4888  hypothetical protein  53.03 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  50.29 
 
 		 219 aa  174  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3680  YceI family protein  48.84 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4578  YceI family protein  43.9 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234901  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06410  YCE I like family protein  50 
 
 		 188 aa  151  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3996  hypothetical protein  42.94 
 
 		 184 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  34.69 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0931  rhodanese-like domain-containing protein  34.68 
 
 		 301 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4376  rhodanese domain-containing protein  34.46 
 
 		 301 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08246  YCE I like family protein  41.34 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1135  YceI family protein  33.7 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.387208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1930  hypothetical protein  35.29 
 
 		 202 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.822803  normal  0.390341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3690  YceI family protein  33.33 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.442684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2792  YceI family protein  27.27 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10138  YCE I like family protein  32.88 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2319  YceI family protein  28.66 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5670  YceI family protein  30.81 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.575338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2552  YceI family protein  31.66 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370741  normal  0.285953 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2718  signal peptide protein  31.76 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.495901  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0371  YceI family protein  27.81 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  33.6 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2962  YceI family protein  32.94 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  33.33 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  30.2 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  31.18 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  32.16 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  36.31 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  38.46 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  31.13 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4184  YceI family protein  32.75 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  32.37 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  32.37 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  32.37 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  32.69 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  30.11 
 
 		 534 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3683  YceI  30.49 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579212  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  44.79 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0682  YceI family protein  32.37 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  44.79 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0458  YceI family protein  30.26 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2321  YceI  26.9 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  40 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  31.34 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  37.93 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  38.64 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  27.49 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  39.81 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.36 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2065  hypothetical protein  28.8 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.257216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  26.92 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  37.88 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5859  YceI family protein  28.25 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  39.81 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  29.76 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  36.59 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  27.37 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  27.07 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  35.77 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2531  YceI family protein  30.12 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2954  hypothetical protein  30.67 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.247116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  39.18 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  39.64 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3325  YceI family protein  34.88 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106411 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  34.26 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  35.61 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  36.54 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.74 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  28.06 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  30.5 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  41.05 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  27.61 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  33.33 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  36.78 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  28.74 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  33.9 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  46.67 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  34.86 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  35.65 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  31.03 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  30.84 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  40.22 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  27.72 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  41.98 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  33.9 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3506  YceI family protein  28.31 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  30.17 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3540  YceI  23.23 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2359  YceI family protein  38.64 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  39.29 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  49.06 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  41.28 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  33.03 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  30.46 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  31.25 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  37.21 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  29.94 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  31.03 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  31.34 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>