76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1701 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1701  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  993    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.201623  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2506  hypothetical protein  41.89 
 
 		 476 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0743  hypothetical protein  37.66 
 
 		 476 aa  276  9e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0406  hypothetical protein  25.88 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000806468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7042  hypothetical protein  25.28 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0202  hypothetical protein  26.05 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.123591  normal  0.549229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0457  hypothetical protein  24.6 
 
 		 482 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6040  hypothetical protein  29.8 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00731139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3992  hypothetical protein  23.33 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.812518  hitchhiker  0.00578478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6877  hypothetical protein  23.03 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611618  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4942  hypothetical protein  32.49 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0081  hypothetical protein  25.62 
 
 		 484 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.898095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2717  hypothetical protein  28.24 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0205  hypothetical protein  25 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0340  hypothetical protein  25.3 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0416919  hitchhiker  0.0002098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0666  hypothetical protein  27.94 
 
 		 525 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2452  hypothetical protein  25.1 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00015704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1165  hypothetical protein  23.64 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.465388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3961  hypothetical protein  25.91 
 
 		 520 aa  73.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.659593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1461  hypothetical protein  24.89 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3552  hypothetical protein  28.02 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.013364  hitchhiker  0.00718584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4237  hypothetical protein  25.94 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0404  hypothetical protein  24.9 
 
 		 488 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201187  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5277  hypothetical protein  26.27 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000791163  normal  0.051402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4499  hypothetical protein  22.94 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6612  hypothetical protein  25.61 
 
 		 546 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05665  hypothetical protein  23.21 
 
 		 500 aa  67  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2712  hypothetical protein  25.47 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1097  hypothetical protein  27.27 
 
 		 508 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.352655  normal  0.684098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0370  hypothetical protein  22.37 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0571  hypothetical protein  27.23 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0588492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3366  hypothetical protein  27.14 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4800  hypothetical protein  24.58 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04170  hypothetical protein  22.99 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.607064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4561  hypothetical protein  30.61 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6879  hypothetical protein  23.05 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0158184  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3788  hypothetical protein  26.61 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.394637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1885  hypothetical protein  22.56 
 
 		 528 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0594  hypothetical protein  24.7 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0727619  normal  0.0815164 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6728  hypothetical protein  24.66 
 
 		 529 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163661  normal  0.843326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3947  hypothetical protein  33.93 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2344  hypothetical protein  24.07 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.164766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3035  hypothetical protein  23.75 
 
 		 533 aa  57.4  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205144  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2769  hypothetical protein  24.1 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0491491  hitchhiker  0.0000539844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2720  hypothetical protein  22.31 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3362  hypothetical protein  19.64 
 
 		 536 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3399  hypothetical protein  21.37 
 
 		 531 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.101775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0968  hypothetical protein  25.75 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.967575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1168  hypothetical protein  24.39 
 
 		 481 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.685851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4224  hypothetical protein  24.19 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0019894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3488  hypothetical protein  21.65 
 
 		 526 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4811  hypothetical protein  26.07 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623974  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1007  hypothetical protein  25.55 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.27911  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2722  hypothetical protein  26.21 
 
 		 482 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2044  hypothetical protein  22.98 
 
 		 532 aa  53.5  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.418532  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1388  hypothetical protein  23.23 
 
 		 552 aa  53.5  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.692819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3030  hypothetical protein  21.98 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.029494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3385  hypothetical protein  23.87 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.680608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2625  hypothetical protein  23.87 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0616  hypothetical protein  22.62 
 
 		 570 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6465  hypothetical protein  23.38 
 
 		 511 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.404265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1104  hypothetical protein  29.03 
 
 		 498 aa  50.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0607512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4558  hypothetical protein  23.28 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.739787  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3219  hypothetical protein  20.53 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1887  hypothetical protein  22.67 
 
 		 530 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1412  hypothetical protein  25 
 
 		 508 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0092306  normal  0.318632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3960  hypothetical protein  25.23 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  normal  0.0980193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6734  hypothetical protein  30.39 
 
 		 543 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.216444  normal  0.227552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4978  hypothetical protein  20.59 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.373185  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2796  hypothetical protein  21.15 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2439  hypothetical protein  27.97 
 
 		 525 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.564687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3979  hypothetical protein  26.06 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0019717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 510 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6790  hypothetical protein  24 
 
 		 487 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0612  hypothetical protein  23.11 
 
 		 515 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0095  hypothetical protein  23.03 
 
 		 473 aa  43.9  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>