More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0675 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  352  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  73.74 
 
 		 179 aa  278  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  73.03 
 
 		 178 aa  267  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  71.51 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  57.54 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  55.56 
 
 		 177 aa  201  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  191  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  54.55 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 180 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 178 aa  180  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.98 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  45.51 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  51.4 
 
 		 180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 180 aa  171  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 187 aa  170  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  167  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>