208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1889 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  55.06 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  54.14 
 
 		 183 aa  175  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  56.6 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  54.09 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  52.47 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  54.14 
 
 		 166 aa  168  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  49.07 
 
 		 294 aa  164  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  47.77 
 
 		 164 aa  160  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  52.63 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  50.64 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  47.13 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  48.1 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 167 aa  145  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4260  hypothetical protein  46.15 
 
 		 166 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905923  normal  0.100966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  45.45 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  42.68 
 
 		 196 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  42.04 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  46.15 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  43.59 
 
 		 182 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  38.31 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  41.38 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  47.18 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  40.25 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.25 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  38.16 
 
 		 251 aa  103  9e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  38.46 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  43.07 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  39.58 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  41.27 
 
 		 135 aa  101  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  39.31 
 
 		 205 aa  101  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  37.59 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  40.27 
 
 		 228 aa  99  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  40.88 
 
 		 162 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  39.19 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  38.64 
 
 		 311 aa  97.4  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.52 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  41.98 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  37.59 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  37.27 
 
 		 237 aa  94.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  38.97 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  37.97 
 
 		 241 aa  94  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  37.69 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  36.36 
 
 		 235 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  34.03 
 
 		 238 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  36.36 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  36.25 
 
 		 238 aa  92.4  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  38.06 
 
 		 251 aa  91.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  35.06 
 
 		 235 aa  91.3  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  35.48 
 
 		 248 aa  90.9  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36.92 
 
 		 178 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  34.19 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  34.19 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  37.76 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  41.1 
 
 		 231 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  33.55 
 
 		 235 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2686  hypothetical protein  35.06 
 
 		 249 aa  88.6  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.468068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0401  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000112089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  37.06 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  34.84 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0891  hypothetical protein  38.93 
 
 		 232 aa  88.6  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.150441  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  36.31 
 
 		 235 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  38.93 
 
 		 234 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  35.59 
 
 		 231 aa  88.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  38.64 
 
 		 151 aa  87  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  37.23 
 
 		 163 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  38.26 
 
 		 233 aa  86.7  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  38.31 
 
 		 240 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  34.66 
 
 		 234 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  37.58 
 
 		 235 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  39.86 
 
 		 265 aa  85.9  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  40.27 
 
 		 231 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  35.17 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  36.49 
 
 		 240 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  33.73 
 
 		 235 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  33.13 
 
 		 235 aa  85.1  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  33.13 
 
 		 235 aa  85.1  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  36.11 
 
 		 239 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  35.06 
 
 		 241 aa  84  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  36.24 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  34.62 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  33.14 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  38.17 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  43.2 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  36.91 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  33.56 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  36.24 
 
 		 265 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  36.91 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  36.91 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>