129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0226 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  100 
 
 		 417 aa  843    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  56.44 
 
 		 431 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  38.79 
 
 		 412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  40.19 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  38.14 
 
 		 435 aa  202  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.66 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  37.44 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  36.78 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.13 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  32.57 
 
 		 460 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.07 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  34.43 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  34.16 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  33.99 
 
 		 430 aa  152  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  32.33 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  34.58 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  32.03 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  35.04 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.5 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  33.59 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  31.38 
 
 		 414 aa  140  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  32.79 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  31.62 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  29.61 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  33.92 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  31.84 
 
 		 409 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  35.16 
 
 		 405 aa  129  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  29.23 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  31.13 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  32.37 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  30.46 
 
 		 415 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.89 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  34.3 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  26.94 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  30.42 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  32.61 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  29.44 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  28.74 
 
 		 407 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.61 
 
 		 421 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  31.62 
 
 		 423 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  29.85 
 
 		 414 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  29.73 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  32.03 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  30.99 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  30.93 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.97 
 
 		 433 aa  96.3  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  26.85 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.45 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  35.58 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  26.43 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.92 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25.5 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  27.15 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  28.42 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.9 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  33.18 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.17 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  23.24 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  31.53 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  23.87 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  31.4 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  21.96 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  28.24 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  22.78 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  24.68 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  26.78 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.36 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  25.49 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  23.81 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  26.22 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  32.41 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.15 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  27.07 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.36 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.36 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  30.83 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  23.97 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.66 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  22.68 
 
 		 449 aa  57  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  29.73 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  26.86 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  24.91 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  27.52 
 
 		 251 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 419 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  28.95 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  31.25 
 
 		 437 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.95 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  25.87 
 
 		 460 aa  53.1  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  22.52 
 
 		 424 aa  53.1  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.06 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  32.39 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  26.6 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.89 
 
 		 433 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.89 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 		 440 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>