153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0159 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  100 
 
 		 380 aa  790    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  35.37 
 
 		 418 aa  226  7e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  39.72 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  34.49 
 
 		 444 aa  209  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  35.16 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  32.45 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  33.16 
 
 		 432 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  31.47 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  31.47 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  32.9 
 
 		 439 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  33.67 
 
 		 449 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  31.22 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  34.55 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  31.97 
 
 		 424 aa  185  9e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  33.15 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  32 
 
 		 431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  33.42 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  32.01 
 
 		 429 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  32.19 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  31.3 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  30.99 
 
 		 435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  29.32 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  33.14 
 
 		 435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  31.69 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  29.52 
 
 		 433 aa  159  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  28.61 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  32.58 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  31.3 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  30.88 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  31.27 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  28.08 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  29.18 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.85 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  31.01 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  28.12 
 
 		 420 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  26.26 
 
 		 405 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  26.58 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  28.89 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  29.46 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  26.72 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.75 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  27.33 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  48.84 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  27.04 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  25.97 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  27.27 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  26.87 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  28.37 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.42 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  24.07 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  26.33 
 
 		 435 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  28.86 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  26.67 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.41 
 
 		 441 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  24.35 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25.68 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  26.67 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.4 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  26.26 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  25.65 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  27.69 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  25.19 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  27.38 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.09 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  27.71 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  24.92 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  24.92 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  25.23 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  24.92 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  24.92 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  24.92 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  26.35 
 
 		 435 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.44 
 
 		 430 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  25.22 
 
 		 440 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.61 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.61 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  23.83 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  25.36 
 
 		 408 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  24.92 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  26.84 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  25.77 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.02 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.06 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  27.84 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  23.7 
 
 		 417 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.6 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.22 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  26.93 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  24.23 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  22.45 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  24.4 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  23.19 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  26.34 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>