74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3752 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3752  putative transmembrane protein  100 
 
 		 337 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5269  band 7 protein  64.18 
 
 		 349 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3449  band 7 protein  60.8 
 
 		 353 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4099  putative transmembrane protein  61.36 
 
 		 371 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.45419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3302  putative transmembrane protein  60.23 
 
 		 344 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4740  putative transmembrane protein  60.73 
 
 		 355 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05341  putative transmembrane protein  61.36 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0246  putative transmembrane protein  62.61 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3459  hypothetical protein  62.43 
 
 		 340 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4234  putative transmembrane protein  58.5 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4122  putative transmembrane protein  58.5 
 
 		 349 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0631102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1369  putative transmembrane protein  65.61 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.748341  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4798  band 7 protein  56.53 
 
 		 353 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4271  putative virion core protein  55.77 
 
 		 356 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5395  band 7 protein  55.94 
 
 		 346 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.29705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3475  putative virion core protein  55.36 
 
 		 346 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833258  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4891  putative virion core protein  55.36 
 
 		 346 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.141045  normal  0.889502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0818  putative virion core protein  61.24 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.300884  normal  0.419853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2274  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  40.06 
 
 		 370 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1383  band 7 protein  46.21 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000962072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  46.03 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  46.03 
 
 		 369 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1850  hypothetical protein  44.19 
 
 		 369 aa  249  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2235  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  44.72 
 
 		 369 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2948  antifreeze protein, type I  44.57 
 
 		 376 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2818  hypothetical protein  44.84 
 
 		 363 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1817  hypothetical protein  46.56 
 
 		 396 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0944379  normal  0.317367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0766  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  43.02 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2794  hypothetical protein  43.08 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10969  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4677  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  35.45 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  41 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1136  hypothetical protein  40.82 
 
 		 360 aa  223  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1287  DNA binding domain-containing protein  38.25 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1999  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  39.44 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6360  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  32.82 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1083  hypothetical protein  37.87 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2448  hypothetical protein  35.66 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0754  hypothetical protein  37.79 
 
 		 353 aa  192  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2246  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  34.41 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0089947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4058  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  33.33 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13522  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3069  hypothetical protein  30.68 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0645  hypothetical protein  29.93 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.319254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1422  antifreeze protein type I  28.04 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000908781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  26.73 
 
 		 433 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3675  YdjI  23.21 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1307  antifreeze protein type I  25.87 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0469  hypothetical protein  28.51 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.87951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3078  YdjI  25.1 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2535  hypothetical protein  28.96 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  33.11 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2022  zinc finger, RanBP2-type  30.43 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000288507 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1039  zinc finger, RanBP2-type  28.18 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47274  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0924  band 7 protein  27.73 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0205933 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0010  zinc finger, RanBP2-type  31.61 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.431527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0476  putative virion core protein  24.71 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000418694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3171  Putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  25.38 
 
 		 397 aa  57  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2485  hypothetical protein  29.51 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1420  hypothetical protein  53.06 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1481  hypothetical protein  24.34 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26070  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)  21.45 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0654  putative virion core protein  21.97 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4151  hypothetical protein  25.83 
 
 		 385 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4327  hypothetical protein  56.76 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  0.47736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5465  hypothetical protein  47.17 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03651  hypothetical protein  45.59 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1657  hypothetical protein  59.46 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3458  hypothetical protein  55.32 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4643  hypothetical protein  63.64 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0622  hypothetical protein  53.19 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0158907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3304  hypothetical protein  54.05 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.195079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3523  HflC protein  21.93 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3614  HflC protein  21.39 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3137  hypothetical protein  46.94 
 
 		 267 aa  42.7  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal  0.151094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3679  HflC protein  21.39 
 
 		 313 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>