More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1564 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1564  ABC transporter related  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0239809  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0447  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1305  ABC transporter-related protein  47.62 
 
 		 212 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000307697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0667  3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferase  44.29 
 
 		 217 aa  191  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1722  methionine import ATP-binding protein MetN  42.45 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.659675  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf140  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.013687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  32.96 
 
 		 320 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  31.52 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  35.91 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.23 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  31.09 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  35.42 
 
 		 301 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  37.79 
 
 		 299 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0696  ABC transporter related  34.93 
 
 		 252 aa  112  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225842  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  32.88 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  36.74 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  32.57 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  31.37 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf625  ABC transporter ATP-binding protein  29.96 
 
 		 353 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.577  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  33.61 
 
 		 306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3524  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf575  ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0450805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  31.47 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2327  ABC transporter related  35.74 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  31.72 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000966  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  32.57 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2089  ABC transporter related  36.24 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116539  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  34.35 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  32.54 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1608  ABC transporter related  31.42 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.249581  normal  0.149154 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  31.63 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  35.89 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  32.75 
 
 		 301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  31.78 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  30.28 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1932  ABC transporter related  33.33 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 300 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  31.67 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  31.48 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0530  ABC transporter ATP-binding protein  32.08 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  37.07 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2723  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.46 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  33.59 
 
 		 329 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  33.49 
 
 		 298 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  37.81 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  30.2 
 
 		 326 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 234 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07006  hypothetical protein  28.41 
 
 		 285 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.86 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1168  ABC transporter related  33.94 
 
 		 335 aa  106  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  31.47 
 
 		 307 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  32.76 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  32.95 
 
 		 306 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.8 
 
 		 315 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4756  ABC transporter related  33.96 
 
 		 299 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1615  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.183501  hitchhiker  0.00912591 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  36.32 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  34.26 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.72 
 
 		 293 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  37.93 
 
 		 318 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  35.75 
 
 		 298 aa  105  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  31.78 
 
 		 306 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  30.45 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0797  ABC transporter, ATP-binding protein  30.05 
 
 		 234 aa  105  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.00354056  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2015  heme exporter protein CcmA  38.03 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  32.67 
 
 		 339 aa  104  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  30.59 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  35.07 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  33.96 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2369  ABC transporter related  34.09 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.766502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  35.55 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  33.63 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.84 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  35 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  34.29 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  33.65 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0906  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 491 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.464739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.14 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  32.71 
 
 		 756 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.79 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  33.18 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  30.83 
 
 		 312 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  31.6 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  37.05 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  31.9 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>