More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3247 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  100 
 
 
299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  49.12 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
307 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  37.31 
 
 
280 aa  170  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.72 
 
 
293 aa  169  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 
284 aa  168  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  39.15 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  39.22 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  38.79 
 
 
287 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  38.79 
 
 
287 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  35.31 
 
 
280 aa  158  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  36.27 
 
 
283 aa  158  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
287 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  37.83 
 
 
287 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  37.83 
 
 
287 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  37.83 
 
 
287 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.53 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.09 
 
 
293 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  37.83 
 
 
287 aa  155  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  35.81 
 
 
304 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  38.25 
 
 
287 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
312 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  37.97 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  39.39 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  34.46 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  32.81 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  33 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  39.07 
 
 
324 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  27.93 
 
 
297 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
300 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.14 
 
 
300 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
300 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 
300 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 
306 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  35.1 
 
 
309 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  30.19 
 
 
304 aa  142  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  36 
 
 
308 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  31.62 
 
 
300 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  38.37 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  32.41 
 
 
300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  36.53 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  33.65 
 
 
326 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0662  ABC transporter related  30.04 
 
 
274 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
300 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  32.02 
 
 
300 aa  139  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  38.03 
 
 
237 aa  139  7.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  27.21 
 
 
286 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  31.62 
 
 
299 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  40.39 
 
 
293 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  36.44 
 
 
309 aa  137  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  34.65 
 
 
306 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.21 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  35.71 
 
 
329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  34.58 
 
 
309 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  33.18 
 
 
308 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  31.84 
 
 
298 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.43 
 
 
301 aa  135  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  34.98 
 
 
306 aa  135  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  34.44 
 
 
282 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  31.27 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  30.91 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  38.29 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  35.5 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.69 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.55 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  35.5 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  29.85 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  35.5 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  28.84 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.17 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  30.51 
 
 
325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  33.11 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  34.75 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0061  ABC transporter related  38.25 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  31.25 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  31.51 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  31.76 
 
 
302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  34.74 
 
 
307 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  39.19 
 
 
295 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  29.87 
 
 
307 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0308  ABC transporter, ATP-binding protein  31.99 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  32.43 
 
 
240 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  34.93 
 
 
320 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  29.67 
 
 
310 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  37.04 
 
 
320 aa  132  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  37.8 
 
 
314 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  32.3 
 
 
306 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  29.3 
 
 
336 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  30.99 
 
 
299 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  34.83 
 
 
307 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  34.7 
 
 
305 aa  132  9e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  37 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.41 
 
 
324 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  32.45 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  28.53 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  35.75 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>