More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0308 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0308  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
298 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1293  ABC transporter ATP-binding protein  54.03 
 
 
293 aa  308  5e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0233393  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0886  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
291 aa  195  9e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00203373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  39.91 
 
 
299 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  39.91 
 
 
299 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
300 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 
300 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
299 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.17 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  34.83 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.52 
 
 
300 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  34.6 
 
 
299 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  32.42 
 
 
322 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  33.21 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  31.45 
 
 
320 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  31.56 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
293 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  30.1 
 
 
303 aa  153  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  36.61 
 
 
305 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.31 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  34.55 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  33.63 
 
 
307 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  33.98 
 
 
329 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  34.84 
 
 
284 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  33.77 
 
 
304 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.98 
 
 
310 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  33.19 
 
 
326 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
300 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  32.8 
 
 
301 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
333 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  33.18 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 
294 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  28.93 
 
 
300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  35.74 
 
 
309 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  33.01 
 
 
314 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  30.43 
 
 
313 aa  138  8.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  30.41 
 
 
309 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  34.22 
 
 
335 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
342 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  34.4 
 
 
315 aa  138  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0195  ABC transporter related  35.21 
 
 
263 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.4 
 
 
327 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  34.08 
 
 
241 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  30 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  30.97 
 
 
301 aa  136  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  34.67 
 
 
355 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  31.71 
 
 
303 aa  136  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  30.09 
 
 
309 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  27.92 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  31.74 
 
 
339 aa  135  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  34.45 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  34.09 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  30.04 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  37.24 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  37.26 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  31 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2770  ABC transporter related  34.7 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  33.18 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  31.96 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 
309 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  35.37 
 
 
302 aa  133  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  31.73 
 
 
282 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2525  ABC transporter related  34.43 
 
 
309 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  32.65 
 
 
289 aa  134  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  28.82 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  34.85 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  34.45 
 
 
309 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  36.52 
 
 
306 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  32.09 
 
 
315 aa  132  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  34.42 
 
 
302 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  35.71 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  31.99 
 
 
299 aa  132  6.999999999999999e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  31.55 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  28.98 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  32.31 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  30.14 
 
 
290 aa  132  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  33.03 
 
 
304 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  30.66 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  31.14 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  30.88 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  38.32 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  31.84 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  38.07 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  26.88 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  31.14 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  33.03 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  33.18 
 
 
345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  31.14 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  32.23 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  33.03 
 
 
373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  28.89 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  36.15 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  30.32 
 
 
343 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>