More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4188 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_4188  ABC transporter related  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4862  ABC transporter related  71.33 
 
 		 280 aa  411  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0070  ABC transporter related  69.31 
 
 		 280 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3778  ABC transporter-related protein  67.73 
 
 		 283 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0059  ABC transporter related  67.83 
 
 		 287 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0073  ABC transporter related  67.83 
 
 		 287 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0075  ABC transporter related  67.83 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0078  ABC transporter related  67.48 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0076  ABC transporter related  67.48 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0074  ABC transporter related  67.48 
 
 		 287 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4276  ABC transporter related  67.83 
 
 		 287 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0078  ABC transporter related  67.48 
 
 		 287 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0073  ABC transporter, ATP-binding protein  67.48 
 
 		 287 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3975  ABC transporter related  65.97 
 
 		 289 aa  385  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  62.95 
 
 		 284 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2233  ABC transporter related  36.49 
 
 		 307 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 307 aa  175  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3247  ABC transporter related  38.27 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  36.16 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4865  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0163871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0881  ABC transporter related protein  38.84 
 
 		 297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  31.99 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  35.61 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  31.66 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  32.88 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1901  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.36 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2163  ABC transporter, ATP-binding protein  32.43 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 		 290 aa  145  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  30.16 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  30.16 
 
 		 290 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  30.16 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  32.34 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  30.56 
 
 		 290 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  31.54 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  28.62 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  31.54 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  31.94 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  29.37 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1982  ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0191587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2130  ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.718107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1164  ABC transporter related  33.47 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  29.37 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  29.37 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.626494  decreased coverage  0.00000786067 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  31.48 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  34.98 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  32.34 
 
 		 293 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4147  ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 293 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  29.97 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  31.56 
 
 		 313 aa  138  7.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0790  multidrug ABC transporter ATPase  34.94 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  29.8 
 
 		 299 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2228  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 287 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367776  hitchhiker  0.00839495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  29.29 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3834  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.754725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2306  ABC transporter related  37.91 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106852  hitchhiker  0.000394376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1477  ABC transporter, ATP-binding protein  30.43 
 
 		 304 aa  136  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.106136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2970  ABC transporter related protein  33.73 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.020184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  36.4 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  29.41 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4099  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 293 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52273e-30 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3908  ABC transporter related  27.6 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0223  ABC transporter related  30.35 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.862249  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  31.14 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4187  ABC transporter, ATP-binding protein  28.67 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  31.63 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3988  ABC transporter ATP-binding protein  27.96 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  28.72 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1344  ABC transporter related  33.93 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4299  ABC transporter ATP-binding protein  27.96 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.170218  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4210  ABC transporter, ATP-binding protein  27.6 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.84 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3818  ABC transporter, ATP-binding protein  27.6 
 
 		 293 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  34.12 
 
 		 307 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  33.92 
 
 		 340 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3078  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3061  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  32.58 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2806  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00781434  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2768  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 290 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1051  ABC transporter, ATP-binding protein  28.32 
 
 		 293 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592378 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0372  ABC transporter related  29.27 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0066  ABC transporter related  34.35 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.24 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4648  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  30.58 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4270  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.95 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.071906  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2834  ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287864  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3048  ABC transporter ATP-binding protein  28.14 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.805565  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  30.25 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  29.93 
 
 		 305 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>