More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0530 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0530  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
269 aa  540  1e-153  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1475  ABC transporter, ATP-binding protein  30.51 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000651776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
294 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  31.2 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  37.33 
 
 
337 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  36.28 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  36.89 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  36.49 
 
 
308 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 
305 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  34.67 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  34.91 
 
 
304 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  38.16 
 
 
247 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  33.95 
 
 
237 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.86 
 
 
366 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  34.91 
 
 
338 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.86 
 
 
366 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 
315 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  30.86 
 
 
337 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.86 
 
 
366 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  36.16 
 
 
304 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  31.9 
 
 
322 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.13 
 
 
317 aa  122  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  34.74 
 
 
338 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  34.74 
 
 
338 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  37.62 
 
 
312 aa  122  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
253 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  30.28 
 
 
322 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  35.32 
 
 
345 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
303 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.92 
 
 
334 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.11 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  33.77 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
373 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  34.7 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
326 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  35.85 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0960  ABC transporter related protein  34.91 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00252533  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1988  ABC transporter related  27.47 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.854169  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2021  ABC transporter related  27.47 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl646  putative multidrug ABC transporter ATP-binding component  32.86 
 
 
234 aa  120  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 
373 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  29.97 
 
 
319 aa  119  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  34.08 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  31.4 
 
 
303 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
304 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  34.78 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  33.62 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  31.88 
 
 
302 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  33.5 
 
 
307 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
320 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  35.59 
 
 
344 aa  119  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  32.87 
 
 
310 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.93 
 
 
334 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  31.28 
 
 
300 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  31.69 
 
 
307 aa  118  7.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  30.41 
 
 
313 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  34.74 
 
 
338 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  35.84 
 
 
355 aa  118  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  35.07 
 
 
302 aa  118  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1380  ABC transporter related  36.82 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00611293  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1407  ABC transporter related  36.82 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.815122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  35.24 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  34.23 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1033  ABC transporter related  34.76 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.107765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.3 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.8 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  33.93 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8858  ABC transporter ATP-binding protein  33.64 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1063  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.74 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.61 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  32.89 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  32.35 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  30.09 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3547  ABC transporter-like protein  33.64 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.757976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  31.96 
 
 
317 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  33.64 
 
 
339 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0018  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 
234 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  29.82 
 
 
309 aa  116  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
351 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  33.64 
 
 
339 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
351 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  33.33 
 
 
315 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.84 
 
 
320 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  33.63 
 
 
317 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1128  putative ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
247 aa  117  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
253 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.36 
 
 
298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  33.81 
 
 
337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  31.98 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  34.29 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3454  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 
253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  33.78 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>