More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0721 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  326  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  60.9 
 
 		 182 aa  205  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  58 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  55.48 
 
 		 183 aa  186  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 182 aa  185  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  55.33 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  55.92 
 
 		 181 aa  183  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  55.92 
 
 		 181 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  56.58 
 
 		 181 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  56.58 
 
 		 181 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  55.92 
 
 		 198 aa  180  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  56.58 
 
 		 181 aa  180  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  56.58 
 
 		 181 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  55.92 
 
 		 181 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  54.61 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 198 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  53.95 
 
 		 181 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  54.25 
 
 		 181 aa  177  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 		 194 aa  177  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  53.95 
 
 		 181 aa  175  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  54.43 
 
 		 194 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  56.85 
 
 		 195 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 195 aa  173  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  54.19 
 
 		 195 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  53.9 
 
 		 183 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  53.25 
 
 		 183 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 		 181 aa  170  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 		 196 aa  167  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  50.97 
 
 		 184 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  50.64 
 
 		 185 aa  165  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  52.9 
 
 		 183 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  52.26 
 
 		 183 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 181 aa  163  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  54.48 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  53.55 
 
 		 183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 182 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 182 aa  160  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 173 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 212 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  53.1 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  46.54 
 
 		 187 aa  149  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 187 aa  148  3e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  46.54 
 
 		 187 aa  148  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  50.97 
 
 		 184 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  42.57 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  42.76 
 
 		 187 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  42.57 
 
 		 187 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 187 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  47.79 
 
 		 183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 190 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  29.93 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  32.05 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  39.53 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  33.06 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 187 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>