More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4412 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  56.93 
 
 		 242 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  56.93 
 
 		 242 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  42.5 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  40.97 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  43.65 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  33.19 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  32.94 
 
 		 381 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  36.99 
 
 		 453 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  36.99 
 
 		 485 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  30.86 
 
 		 309 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  27.98 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  36.42 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  32.96 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 825 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 825 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 862 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 825 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 825 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 825 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  30.3 
 
 		 521 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.49 
 
 		 567 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  33.9 
 
 		 870 aa  72  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  27.94 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  32.57 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  30.73 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 		 976 aa  70.5  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  29.82 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  23.98 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  23.98 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  32.64 
 
 		 600 aa  68.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  30.85 
 
 		 286 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  31.98 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 		 949 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  28.43 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  30.95 
 
 		 734 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  30.9 
 
 		 515 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  31.45 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  29.76 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.05 
 
 		 363 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.33 
 
 		 401 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  23.53 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  31.87 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 		 862 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 		 442 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1946  hypothetical protein  28.02 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 		 576 aa  65.1  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  28.73 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  26.34 
 
 		 452 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  27.91 
 
 		 359 aa  65.1  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  29.89 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  26.64 
 
 		 710 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1048  pentapeptide repeat-containing protein  33.79 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0897049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.98 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  33.97 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  32.7 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  26.18 
 
 		 727 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  32.12 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  29.38 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.61 
 
 		 872 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.68 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  32.7 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.47 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  29.82 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0469  pentapeptide repeat-containing protein  32.64 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0713462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  30.67 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  21.56 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  30.11 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.59 
 
 		 14916 aa  62.4  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  31.28 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 355 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  34.24 
 
 		 456 aa  62  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  29.07 
 
 		 389 aa  62  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  30.38 
 
 		 360 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  29.01 
 
 		 218 aa  62  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 881 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 		 360 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 		 360 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  24.6 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  26.02 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1719  pentapeptide repeat-containing protein  26.49 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019044  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  30.38 
 
 		 360 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  30.38 
 
 		 360 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  32.26 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 880 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  30.05 
 
 		 877 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0639  hypothetical protein  31.33 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.487238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  26.98 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0344  pentapeptide repeat-containing protein  30.38 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.61884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>