More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1152 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1152  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0780  hypothetical protein  70.61 
 
 		 330 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5015  hypothetical protein  73.29 
 
 		 324 aa  479  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0488  hypothetical protein  69.3 
 
 		 328 aa  474  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0463  hypothetical protein  68.39 
 
 		 329 aa  474  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.474593  normal  0.230992 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0454  hypothetical protein  68.39 
 
 		 329 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.746083  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3442  hypothetical protein  61.7 
 
 		 324 aa  427  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0502272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3143  hypothetical protein  64.71 
 
 		 323 aa  411  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.618772  hitchhiker  0.000811526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1645  hypothetical protein  59.7 
 
 		 325 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0597  hypothetical protein  57.06 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3614  hypothetical protein  59.81 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.200616 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0709  hypothetical protein  50.3 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.802476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0130  hypothetical protein  51.38 
 
 		 328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0166  hypothetical protein  50.48 
 
 		 328 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0115  hypothetical protein  51.16 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.370387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1330  hypothetical protein  52.05 
 
 		 328 aa  318  6e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3168  hypothetical protein  49.85 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398802  normal  0.905339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  49.52 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4800  hypothetical protein  53 
 
 		 358 aa  315  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308675  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2138  hypothetical protein  51.32 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104945  decreased coverage  0.00594387 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3900  extra-cytoplasmic solute receptor  51.15 
 
 		 398 aa  315  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.264332  normal  0.374616 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4104  hypothetical protein  49.84 
 
 		 325 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.513428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1244  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  312  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.275742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3459  hypothetical protein  49.24 
 
 		 327 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0172723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3423  hypothetical protein  46.81 
 
 		 325 aa  308  9e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.124175  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0201  hypothetical protein  50.5 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0133  hypothetical protein  49.83 
 
 		 335 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2029  hypothetical protein  50.83 
 
 		 334 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3883  hypothetical protein  46.33 
 
 		 324 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4404  hypothetical protein  46.45 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2566  hypothetical protein  41 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270371  normal  0.120506 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0552  hypothetical protein  40.59 
 
 		 332 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1697  hypothetical protein  41.06 
 
 		 331 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.316918  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1624  hypothetical protein  40.73 
 
 		 331 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1438  hypothetical protein  42.05 
 
 		 330 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  38.71 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  38.71 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  38.44 
 
 		 323 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  41.86 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.31 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2249  hypothetical protein  41.39 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3355  hypothetical protein  38.87 
 
 		 337 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  41.08 
 
 		 329 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  39.04 
 
 		 334 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.12 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3356  hypothetical protein  40.92 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135205  hitchhiker  0.00401595 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  40.51 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  38.41 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2872  hypothetical protein  37.74 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.446965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  40.98 
 
 		 324 aa  215  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  37.5 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  38.22 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1320  hypothetical protein  36.54 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.337446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.66 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1516  hypothetical protein  36.54 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.99 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  36.65 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  38.82 
 
 		 330 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.08 
 
 		 356 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.86 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  37.7 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2980  hypothetical protein  35.69 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.57 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3267  hypothetical protein  39.47 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.405324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.99 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  37.21 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  37.21 
 
 		 341 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.84 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  37.58 
 
 		 336 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  36.72 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2035  hypothetical protein  37.78 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6145  hypothetical protein  38.23 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  38.91 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1498  hypothetical protein  35.93 
 
 		 351 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  35.95 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.63 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  36.42 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  36.78 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  37.58 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3811  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  39.8 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  37.92 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  38.22 
 
 		 327 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3797  hypothetical protein  38.05 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36.64 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  36.51 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.46 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  36.33 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  39.67 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  37.1 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  37.67 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  39.41 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  38.03 
 
 		 326 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.08 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6193  hypothetical protein  37.01 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0012  hypothetical protein  34.09 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  36.39 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  39.29 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  37.14 
 
 		 324 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>