More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4726 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  55.24 
 
 
963 aa  990    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  52.78 
 
 
971 aa  984    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  53.09 
 
 
971 aa  994    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  38.08 
 
 
1097 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
959 aa  1918    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  56 
 
 
975 aa  1022    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  52.24 
 
 
956 aa  927    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  26.05 
 
 
890 aa  200  9e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  27.33 
 
 
854 aa  187  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  25.66 
 
 
868 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  26.14 
 
 
865 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  26.76 
 
 
870 aa  182  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.67 
 
 
840 aa  180  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  25.4 
 
 
874 aa  179  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.35 
 
 
903 aa  179  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.88 
 
 
891 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.11 
 
 
887 aa  174  9e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  24.43 
 
 
884 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  25.58 
 
 
889 aa  172  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  26.4 
 
 
842 aa  167  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  24.01 
 
 
868 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  27.34 
 
 
842 aa  158  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  27.34 
 
 
842 aa  158  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  26.63 
 
 
892 aa  158  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  28.29 
 
 
886 aa  156  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.6 
 
 
852 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.45 
 
 
869 aa  148  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  23.49 
 
 
868 aa  146  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  24.13 
 
 
825 aa  146  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  25.85 
 
 
725 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  25.77 
 
 
708 aa  139  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  25.53 
 
 
902 aa  135  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  27.54 
 
 
891 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  27.08 
 
 
868 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.61 
 
 
887 aa  124  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.95 
 
 
821 aa  121  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  26.46 
 
 
868 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  26.46 
 
 
868 aa  119  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  29.9 
 
 
906 aa  118  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  32.87 
 
 
788 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  25.85 
 
 
868 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  24.93 
 
 
592 aa  115  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  30.43 
 
 
866 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  27.18 
 
 
837 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  25.62 
 
 
869 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.98 
 
 
797 aa  111  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  25.31 
 
 
868 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.91 
 
 
867 aa  110  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.61 
 
 
811 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  25.71 
 
 
869 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  29.14 
 
 
871 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.16 
 
 
950 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.29 
 
 
873 aa  107  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  31.88 
 
 
594 aa  107  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  28.2 
 
 
907 aa  107  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  36.25 
 
 
826 aa  107  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  23.58 
 
 
868 aa  106  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  25.76 
 
 
537 aa  105  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2388  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  22.01 
 
 
812 aa  105  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.53 
 
 
791 aa  103  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  36.36 
 
 
765 aa  102  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  24.73 
 
 
560 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1575  hypothetical protein  33.65 
 
 
610 aa  102  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0270865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  36.98 
 
 
275 aa  102  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  32.87 
 
 
758 aa  100  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  30.7 
 
 
758 aa  99  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  32.47 
 
 
366 aa  99.4  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  30.88 
 
 
758 aa  99  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  35.58 
 
 
971 aa  98.6  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  34.11 
 
 
835 aa  97.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 
757 aa  97.4  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  35.51 
 
 
359 aa  97.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.44 
 
 
835 aa  97.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  41.46 
 
 
386 aa  95.5  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.5 
 
 
302 aa  94.4  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  29.61 
 
 
871 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  26.05 
 
 
1240 aa  94  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  41.75 
 
 
622 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  27.33 
 
 
885 aa  93.6  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.93 
 
 
386 aa  93.2  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  44.55 
 
 
760 aa  92.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  29.77 
 
 
769 aa  92  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  32.6 
 
 
364 aa  91.3  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  27.01 
 
 
885 aa  90.9  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  31.92 
 
 
779 aa  91.3  9e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  43.69 
 
 
609 aa  90.9  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  40.78 
 
 
602 aa  90.9  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.31 
 
 
810 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  29.56 
 
 
758 aa  90.1  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  31.7 
 
 
761 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.17 
 
 
758 aa  89.7  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  45 
 
 
312 aa  89.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  30.84 
 
 
764 aa  88.6  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  31.58 
 
 
754 aa  88.6  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  33.47 
 
 
434 aa  87.8  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  32.09 
 
 
781 aa  87.8  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  28.75 
 
 
758 aa  87.4  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  32.7 
 
 
761 aa  87.4  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  30.73 
 
 
762 aa  86.7  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1987  Pyruvate, water dikinase  33.77 
 
 
918 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>