88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0878 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0878  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
331 aa  663    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.213788  hitchhiker  0.0000283657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2811  tetratricopeptide repeat-containing protein  50.53 
 
 
285 aa  262  6.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0556541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0666  TPR repeat-containing protein  50.75 
 
 
293 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.107374  normal  0.0631773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2395  tetratricopeptide TPR_2  47.66 
 
 
300 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4498  Tetratricopeptide domain protein  39.48 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1134  TPR repeat-containing protein  40.67 
 
 
286 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1164  TPR repeat-containing protein  40.67 
 
 
286 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660548  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2280  TPR repeat-containing protein  42.08 
 
 
310 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2166  hypothetical protein  35.59 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0350  hypothetical protein  37.07 
 
 
132 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0301232  normal  0.125354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  29.07 
 
 
519 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1228  hypothetical protein  36.47 
 
 
204 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1258  hypothetical protein  36.47 
 
 
204 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000323841 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  32.46 
 
 
573 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3521  TPR domain protein  32.79 
 
 
245 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 
402 aa  52.8  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 
1069 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1620  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.98 
 
 
1979 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
968 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  24.41 
 
 
1415 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  34.84 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
597 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
878 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
620 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
934 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 
648 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.11 
 
 
810 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1821  hypothetical protein  29.36 
 
 
119 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867185  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 
573 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 
592 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2982  heat shock protein 70  30.25 
 
 
812 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
804 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 
1694 aa  47.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4639  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
311 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
883 aa  46.6  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3930  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
974 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  25.46 
 
 
620 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.76 
 
 
576 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.51 
 
 
267 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  29.66 
 
 
520 aa  46.2  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  33.75 
 
 
733 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.29 
 
 
967 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  25.14 
 
 
992 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  24.08 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
952 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1030  cellulose synthase operon protein C  24.72 
 
 
1230 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0582  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
762 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.79 
 
 
572 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  27.81 
 
 
475 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 
581 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
2262 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  23.62 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
1049 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.2 
 
 
793 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  25 
 
 
590 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.76 
 
 
676 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  22.78 
 
 
2401 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0047  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
788 aa  43.9  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.210348  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 
572 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
544 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  21.17 
 
 
3560 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
1085 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  25 
 
 
575 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
1737 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 
452 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 
263 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
374 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 
194 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.53 
 
 
739 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 
562 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.34 
 
 
573 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  22.39 
 
 
586 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.35 
 
 
707 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 
884 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  22.16 
 
 
299 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3816  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
3936 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 
689 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
827 aa  42.7  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25.66 
 
 
564 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 
466 aa  42.7  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 
1276 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>