94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0372 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0372  type 4 prepilin-like protein  100 
 
 		 179 aa  354  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1601  type 4 pilin  35.8 
 
 		 162 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5159  type 4 prepilin-like protein  32.1 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.259971  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3385  type IV pilin protein, putative  35.47 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1711  type 4 prepilin-like protein  34.91 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1736  hypothetical protein  35.9 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0267  hypothetical protein  37.08 
 
 		 225 aa  57.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  29.49 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3404  fimbrial biogenesis protein  36.36 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  26.79 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0486  pilin assembly protein  28.03 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00295768  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  46.81 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  32.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  40 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0715  pillin, putative  32.29 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.47 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  29.45 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.37 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  26.17 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1142  general secretion  32.46 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000033549  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  28.97 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.48 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  27.7 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 139 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  21.84 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0271  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  25.42 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  46.94 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5000  hypothetical protein  25.39 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  36.49 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0933  methylation site containing protein  22.78 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  31.25 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  38.36 
 
 		 175 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0971  general secretion pathway protein H  25.42 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  36.62 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  44.44 
 
 		 146 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  32.05 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.59 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  37.1 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  31.17 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0108  pilin  26.29 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  44.9 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  38.78 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  51.22 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  37.5 
 
 		 170 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  36.36 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  27.38 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  37.1 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  34.48 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  41.51 
 
 		 137 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3521  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.87 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  43.75 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  38.64 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  35.82 
 
 		 138 aa  42.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  26.71 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.9 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  41.46 
 
 		 567 aa  42.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3126  methylation site containing protein  25.66 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  37.29 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2947  methylation site containing protein  25.66 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0992621  normal  0.405183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2038  fimbrial protein pilin  33.33 
 
 		 129 aa  42.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  27.45 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  33.72 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  42.5 
 
 		 527 aa  42.4  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  26.95 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  40.38 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  33.33 
 
 		 154 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06981  hypothetical protein  25.71 
 
 		 201 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  46.34 
 
 		 187 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  35.85 
 
 		 152 aa  42  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  31.25 
 
 		 161 aa  42  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  37.5 
 
 		 138 aa  42  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  30.12 
 
 		 163 aa  42  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  35.38 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2447  hypothetical protein  32.47 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  28.78 
 
 		 157 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  37.74 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.21 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.06 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.59 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  37.5 
 
 		 144 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0462503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  47.73 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  28.74 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  52.63 
 
 		 155 aa  41.2  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  35.71 
 
 		 111 aa  41.2  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  55.26 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  43.14 
 
 		 198 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  43.9 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  55.26 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.03 
 
 		 163 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  40 
 
 		 134 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  27.88 
 
 		 181 aa  40.8  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.693608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>