More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0430 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0430  inner-membrane translocator  100 
 
 
293 aa  553  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151823  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  44.95 
 
 
292 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  47.46 
 
 
290 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  45.42 
 
 
290 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  43 
 
 
292 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  43.34 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  42.66 
 
 
292 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  44.03 
 
 
292 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  43.69 
 
 
292 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  38.01 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.93 
 
 
290 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  40.48 
 
 
292 aa  175  8e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
294 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  38.51 
 
 
291 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  39.06 
 
 
290 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43530  amino acid ABC transporter-like protein  37.2 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0533478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
290 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
293 aa  159  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  33 
 
 
295 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2989  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
293 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115957  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  37.2 
 
 
294 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
294 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.9 
 
 
290 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
297 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 
297 aa  153  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.76 
 
 
289 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  34.07 
 
 
319 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  34.78 
 
 
294 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  30 
 
 
297 aa  149  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  32.24 
 
 
297 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  32.09 
 
 
292 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  33.11 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
294 aa  146  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  35.84 
 
 
293 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  31.49 
 
 
297 aa  145  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  35.84 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
293 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  32.65 
 
 
291 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
294 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  37.02 
 
 
291 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.02 
 
 
316 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  32.99 
 
 
293 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.02 
 
 
316 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  35.02 
 
 
316 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
316 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  35 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  34.38 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.7 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.8 
 
 
316 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
290 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
316 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
316 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
316 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  32.88 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  33.88 
 
 
291 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1437  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
297 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522267  hitchhiker  0.00000379274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
316 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
316 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
316 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  32.56 
 
 
297 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  34.17 
 
 
316 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
293 aa  138  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  28 
 
 
297 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  34.13 
 
 
289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 
296 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2749  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  34.01 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0611972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  34.21 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
301 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  38.95 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  33.96 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5147  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  33.78 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  37.71 
 
 
293 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3004  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.961727  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  31.27 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  33.56 
 
 
291 aa  132  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3492  inner-membrane translocator  34.68 
 
 
293 aa  132  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3800  inner-membrane translocator  34.68 
 
 
293 aa  132  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.469116  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0137  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
302 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  31.73 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3874  inner-membrane translocator  34.34 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  37.21 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  35.03 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  29.69 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2425  inner-membrane translocator  35.12 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4592  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
283 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.06 
 
 
316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.68 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  32.05 
 
 
311 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  32.26 
 
 
309 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  30.51 
 
 
291 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1212  inner-membrane translocator  31.75 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  29.25 
 
 
292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  30.97 
 
 
338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  32.75 
 
 
290 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  33 
 
 
291 aa  129  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  31.67 
 
 
291 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>