More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0332 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  44.44 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4931  transcriptional regulator, XRE family  38.17 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5072  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_003296  RS04780  putative transcription regulator protein  31.03 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05657  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  31.03 
 
 		 205 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1787  Cro/CI family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0263563  normal  0.220225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1668  Cro/CI family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.118403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1789  transcriptional regulator, Cro/CI family  29.73 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1849  Cro/CI family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1487  transcriptional regulator, Cro/CI family  29.19 
 
 		 200 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.335106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3529  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.295271 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  28.32 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3308  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.38656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0134  hypothetical protein  26.34 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1211  helix-turn-helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1579  transcriptional regulator  24.18 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  28.81 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3508  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0510026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2232  Cro/CI family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3441  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.404086 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1109  XRE family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4229  hypothetical protein  32.76 
 
 		 652 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.60873 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1096  helix-turn-helix domain-containing protein  24.18 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1855  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  35.47 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0744  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.541206  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  25.82 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  25.82 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.82 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  25.82 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  25.82 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  25.82 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  25.82 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4804  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.03 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0831  XRE family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000078794  normal  0.173113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2346  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.76 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0503  transcriptional regulator, XRE family  33.16 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0483553 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3086  transcriptional regulator, putative  25 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0196484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  28.18 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1663  DNA-binding protein  23.64 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2039  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3726  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3469  DNA-binding protein  31.76 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.162788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  26.11 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  25.54 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1428  DNA-binding protein  31.72 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2019  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.649802  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3191  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.479355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1881  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0895  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.955987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3174  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9176  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  24.04 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3137  DNA-binding protein  31.3 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4478  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02293  putative transcription regulator protein  29.44 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.40687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1354  XRE family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758784  decreased coverage  0.00460659 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  24.85 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  29.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3551  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0950  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00163253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4257  transcriptional regulator, XRE family  26.7 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  29.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4454  XRE family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561636  normal  0.472987 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.49 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  25.14 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  24.86 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  29.28 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>