More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2367 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  100 
 
 		 291 aa  589  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  37.5 
 
 		 281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  35.48 
 
 		 341 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  32.49 
 
 		 345 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  31.41 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  31.99 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  31.8 
 
 		 217 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  29.82 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  29.12 
 
 		 256 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  27.37 
 
 		 246 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  27.82 
 
 		 219 aa  112  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4545  60 kDa inner membrane insertion protein  30.04 
 
 		 462 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.374078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3334  Oxa1 family transporter: 60 KD inner membrane protein OxaA-like protein  29.23 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.890029  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43657  predicted protein  26.05 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0705  60 kDa inner membrane insertion protein  31.09 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7338  60 kDa inner membrane insertion protein  29.93 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  0.710284 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.96 
 
 		 249 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  28.62 
 
 		 225 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  27.46 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  31.25 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4959  60 kDa inner membrane insertion protein  30.22 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000507669  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  44.04 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  27.46 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14180  preprotein translocase subunit YidC  27.5 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  28.04 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4240  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.71 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.148163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  26.41 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  27.11 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  27.11 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  27.11 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  27.11 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  27.11 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  27.11 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  26.99 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28520  preprotein translocase subunit YidC  27.21 
 
 		 257 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000336467  hitchhiker  0.00141204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  24.91 
 
 		 553 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3121  60 kDa inner membrane insertion protein  29.24 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000331776  hitchhiker  0.0000000745371 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1631  60 kDa inner membrane insertion protein  50.56 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.22695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2932  60 kDa inner membrane insertion protein  41.28 
 
 		 213 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000772095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.24 
 
 		 555 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  28.06 
 
 		 257 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  45.63 
 
 		 454 aa  99.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  28.82 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9387  Preprotein translocase subunit YidC-like protein  26.88 
 
 		 316 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3114  hypothetical protein  25.96 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00051538  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  43.81 
 
 		 539 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  42.59 
 
 		 542 aa  98.6  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.24 
 
 		 555 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  49.47 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  28.78 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  29.23 
 
 		 224 aa  97.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  31.66 
 
 		 584 aa  96.3  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  46.51 
 
 		 536 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.08 
 
 		 238 aa  96.3  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  38.18 
 
 		 309 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  45.74 
 
 		 459 aa  95.9  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2158  60 kDa inner membrane insertion protein  26.52 
 
 		 315 aa  95.9  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46411  predicted protein  25.75 
 
 		 467 aa  95.5  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.8 
 
 		 544 aa  95.1  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  28.68 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2396  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.68 
 
 		 582 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 		 554 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 		 553 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0831  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.55 
 
 		 376 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.983915 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0606  60 kDa inner membrane insertion protein  50.56 
 
 		 465 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00155315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 		 554 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1038  60 kDa inner membrane insertion protein  50.56 
 
 		 448 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0516206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7097  60 kDa inner membrane insertion protein  25.67 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.123004  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 		 553 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4982  60 kDa inner membrane insertion protein  26.74 
 
 		 351 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 		 552 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  42.45 
 
 		 531 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 		 552 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13956  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.36 
 
 		 366 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  27.99 
 
 		 559 aa  93.2  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 558 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 558 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 558 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 558 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 558 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  27.61 
 
 		 584 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 558 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 557 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 558 aa  92.8  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  25.62 
 
 		 557 aa  92.8  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  27.13 
 
 		 553 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.37 
 
 		 579 aa  92.4  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 550 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  40.59 
 
 		 607 aa  92.4  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.45 
 
 		 554 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1333  60 kDa inner membrane insertion protein  50.56 
 
 		 443 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000542942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  28.63 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  29.74 
 
 		 583 aa  91.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1353  60 kDa inner membrane insertion protein  50.56 
 
 		 443 aa  91.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0957559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.45 
 
 		 554 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  31.4 
 
 		 587 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  24.14 
 
 		 547 aa  91.3  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.7 
 
 		 555 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.66 
 
 		 575 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2035  60 kDa inner membrane insertion protein  27.17 
 
 		 336 aa  90.9  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>