More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1606 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  60.4 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  61.54 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  62.02 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  62.69 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  60 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  61.69 
 
 		 210 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  54.55 
 
 		 219 aa  221  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  60 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  60 
 
 		 211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  58.1 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  59.02 
 
 		 218 aa  215  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  60.8 
 
 		 207 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  58.05 
 
 		 210 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  60.41 
 
 		 210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  55.02 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  57.71 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  54.03 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  52.79 
 
 		 204 aa  200  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  56.35 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  53.77 
 
 		 203 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  55.28 
 
 		 203 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  52.91 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  51.94 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 206 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  46.89 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  52.43 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  51.94 
 
 		 206 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  55.07 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  52.71 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  50.97 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1878  dTMP kinase  54.9 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.04271 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  54.31 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  54.31 
 
 		 223 aa  185  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 206 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  50 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  53.59 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0970  dTMP kinase  52.43 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1918  thymidylate kinase  54.33 
 
 		 217 aa  174  9e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  51.98 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  46.19 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  56.44 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  46.92 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  48.51 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  50 
 
 		 205 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  48.33 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  45.97 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  43.84 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0877  dTMP kinase  53.73 
 
 		 221 aa  168  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0484  thymidylate kinase  51.69 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  54.45 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  49 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  49.05 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  47.14 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  49.03 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.12 
 
 		 219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  48.61 
 
 		 217 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  47.62 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  48.61 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  43.06 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  49.04 
 
 		 224 aa  164  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.18 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1257  thymidylate kinase  48.56 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.199425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  51.46 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  49.76 
 
 		 244 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 215 aa  161  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 212 aa  161  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  46 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  48.68 
 
 		 688 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  47.12 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  45.67 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  45.37 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.52 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3412  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  50 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1454  thymidylate kinase  44.27 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.499935  hitchhiker  0.00267857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>