55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5740 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  100 
 
 		 446 aa  931    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  56.7 
 
 		 453 aa  535  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  58.33 
 
 		 587 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  52.46 
 
 		 433 aa  438  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  48.36 
 
 		 442 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  46.72 
 
 		 450 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  44.94 
 
 		 424 aa  372  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  45.01 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  44.16 
 
 		 445 aa  356  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  44.57 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  41.78 
 
 		 440 aa  339  5e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  46.99 
 
 		 469 aa  330  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  42.5 
 
 		 435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  30.95 
 
 		 583 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  30.04 
 
 		 589 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  30.79 
 
 		 737 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  29.86 
 
 		 532 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  29.09 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  29.3 
 
 		 533 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  28.6 
 
 		 658 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  27.76 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  27.94 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  26.26 
 
 		 604 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.33 
 
 		 612 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  27.48 
 
 		 535 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  27.55 
 
 		 407 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  25.96 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  29 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  27.79 
 
 		 548 aa  136  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  27.77 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  26.35 
 
 		 677 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  27.54 
 
 		 567 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  25.97 
 
 		 597 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  26.76 
 
 		 693 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  28.46 
 
 		 408 aa  124  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  26.8 
 
 		 535 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  23.72 
 
 		 558 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  23.31 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  23.74 
 
 		 541 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  25.23 
 
 		 547 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  27.76 
 
 		 403 aa  103  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  25.71 
 
 		 727 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  26.37 
 
 		 411 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  22.74 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  23.09 
 
 		 631 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  22.09 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  22.57 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  23.21 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  24.48 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  21.66 
 
 		 850 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  23.56 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  22.17 
 
 		 1172 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  25.82 
 
 		 824 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  21.95 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.72 
 
 		 683 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>