176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5281 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5281  Mammalian cell entry related domain protein  100 
 
 
340 aa  678    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.192594 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0188  Mammalian cell entry related domain protein  47.34 
 
 
337 aa  324  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107684  normal  0.968767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2984  ABC transporter, permease component  46.23 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395413  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1810  Mammalian cell entry related domain protein  46.18 
 
 
341 aa  309  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0795  Mammalian cell entry related domain protein  44.97 
 
 
328 aa  297  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3316  Mammalian cell entry related domain protein  31.9 
 
 
266 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.635964  hitchhiker  0.0000217652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4316  hypothetical protein  30.43 
 
 
279 aa  116  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1243  hypothetical protein  27.15 
 
 
360 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1873  Mammalian cell entry related domain protein  28.11 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.010294 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0678  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.828772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3705  hypothetical protein  23.99 
 
 
349 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0687  hypothetical protein  25.09 
 
 
332 aa  79.3  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1508  Mammalian cell entry related domain protein  24.38 
 
 
356 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.577537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3214  hypothetical protein  24.92 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1272  virulence factor MCE-like protein-related protein  23.4 
 
 
347 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.821992  hitchhiker  0.0000000117847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0707  Mammalian cell entry related domain protein  22.95 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.886561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2254  Mammalian cell entry related domain protein  24.44 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.371924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2541  virulence factor MCE-like protein-related protein  25.51 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143277  hitchhiker  0.00000000000784881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0926  mce-related protein  23.91 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6192  Mammalian cell entry related domain protein  25.73 
 
 
332 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.387563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0031  hypothetical protein  23.59 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.929118  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1696  Mammalian cell entry related domain protein  23.67 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2733  Mammalian cell entry related domain protein  23.18 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0661  hypothetical protein  24.89 
 
 
292 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0478  VpsC protein  24.29 
 
 
292 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.238955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1899  virulence factor Mce family protein  22.74 
 
 
349 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4517  hypothetical protein  22.19 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1739  Mammalian cell entry related domain protein  26.32 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  24.53 
 
 
307 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0495  Mammalian cell entry related domain protein  23.53 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  23.3 
 
 
312 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  23.23 
 
 
312 aa  57  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2448  hypothetical protein  23.02 
 
 
333 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1622  Mammalian cell entry related domain protein  27.5 
 
 
446 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0440  VpsC protein  25.12 
 
 
292 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0704  virulence factor Mce family protein  26.81 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  22.58 
 
 
312 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.32 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  24.86 
 
 
360 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  24.86 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  29.37 
 
 
310 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 
360 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  34.13 
 
 
148 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  33.58 
 
 
148 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  28.91 
 
 
151 aa  52.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.56 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  23.38 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  29.75 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  26.56 
 
 
321 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  23.24 
 
 
305 aa  52  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  30.43 
 
 
150 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  31.03 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  23.1 
 
 
312 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  29.31 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  32.2 
 
 
150 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  29.13 
 
 
152 aa  50.1  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0329  hypothetical protein  20.95 
 
 
430 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.967579  normal  0.70235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  31.2 
 
 
149 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1655  putative ABC transporter  22.61 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  31.58 
 
 
148 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0709  virulence factor Mce family protein  33.33 
 
 
523 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.936925  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  22.88 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4165  virulence factor Mce family protein  24.68 
 
 
487 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  24.84 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1854  Mammalian cell entry related domain protein  23.44 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000329704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  26.27 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  26.96 
 
 
288 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0393  Mammalian cell entry related domain protein  23.92 
 
 
515 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  26.27 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  22.29 
 
 
312 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  48.1  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0135  virulence factor Mce family protein  32.46 
 
 
343 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  28.57 
 
 
150 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  32.31 
 
 
152 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2591  hypothetical protein  25.15 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703679  normal  0.200982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1557  virulence factor Mce family protein  20.47 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4901  Mammalian cell entry related domain protein  23.4 
 
 
328 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.374077  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.09 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  25.89 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  21.12 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  31.53 
 
 
148 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0710  virulence factor Mce family protein  31.58 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.476442  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.12 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  29.71 
 
 
158 aa  47  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2218  hypothetical protein  27.64 
 
 
154 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1529  virulence factor MCE-like protein  26.49 
 
 
479 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1552  virulence factor Mce family protein  26.49 
 
 
479 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.977582  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1217  Mammalian cell entry related domain protein  25.15 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  20.73 
 
 
296 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4148  virulence factor Mce family protein  29.7 
 
 
367 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  20.71 
 
 
296 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03181  ABC transporter substrate-binding protein  22.89 
 
 
308 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721062  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1015  hypothetical protein  22.85 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  25.41 
 
 
152 aa  46.2  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0638  hypothetical protein  31.82 
 
 
306 aa  46.6  0.0007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.498696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2511  virulence factor Mce family protein  23.91 
 
 
503 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.309476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1894  hypothetical protein  26.17 
 
 
324 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3977  virulence factor Mce family protein  25.57 
 
 
479 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5201  virulence factor Mce family protein  22.18 
 
 
341 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.922675  normal  0.183603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>