More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5107 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  100 
 
 		 338 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  40.98 
 
 		 345 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0904  beta-lactamase  29.52 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0914  hypothetical protein  30.15 
 
 		 398 aa  140  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2964  beta-lactamase  32.05 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3369  beta-lactamase  29.64 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3266  beta-lactamase  30.14 
 
 		 397 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0756  beta-lactamase  29.75 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.337728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3184  beta-lactamase  29.05 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.94 
 
 		 487 aa  132  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0856  beta-lactamase  29.14 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  29.25 
 
 		 578 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  26.69 
 
 		 417 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3516  beta-lactamase  28.88 
 
 		 465 aa  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  30.48 
 
 		 369 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  28.74 
 
 		 446 aa  112  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  29.94 
 
 		 356 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  32.3 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.52 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2619  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606366  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.97 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  27.78 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  27.49 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  30.63 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.09 
 
 		 848 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  27.36 
 
 		 603 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  26.85 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  27.04 
 
 		 593 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  30.74 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  28.48 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  26.93 
 
 		 611 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  28.57 
 
 		 470 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  27.47 
 
 		 537 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0973  beta-lactamase  30.5 
 
 		 514 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28.69 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3688  beta-lactamase  25.8 
 
 		 543 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.011807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2177  beta-lactamase  25.8 
 
 		 543 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  26.1 
 
 		 413 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  26.58 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.79 
 
 		 422 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  26.44 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  29.14 
 
 		 338 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  26.25 
 
 		 421 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.13 
 
 		 442 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.86 
 
 		 388 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.47 
 
 		 413 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  31.28 
 
 		 347 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  27.62 
 
 		 321 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  26.16 
 
 		 416 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  28.4 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01195  penicillin-binding protein  26.95 
 
 		 559 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.119719  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1457  beta-lactamase  30.3 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.17461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  26.25 
 
 		 416 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  29.77 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.87 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.43 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1712  beta-lactamase  26.88 
 
 		 477 aa  90.1  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.419371  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  26.49 
 
 		 404 aa  89.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4280  beta-lactamase  27.72 
 
 		 330 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2353  penicillin-binding protein  27.94 
 
 		 481 aa  89.4  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000218323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  25.72 
 
 		 380 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5443  putative beta-lactamase  30.29 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.65256  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  27.18 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  29.52 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  23.16 
 
 		 493 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  29.44 
 
 		 388 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  29.44 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  26.2 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2400  penicillin-binding protein  26.69 
 
 		 481 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443561  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2575  penicillin-binding protein  26.69 
 
 		 481 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  26.55 
 
 		 513 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  26.86 
 
 		 374 aa  86.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  24.12 
 
 		 430 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  27.63 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  28.05 
 
 		 388 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2579  penicillin-binding protein, putative  27.2 
 
 		 483 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0220569  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5119  beta-lactamase  28.62 
 
 		 402 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.05 
 
 		 389 aa  85.9  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5167  beta-lactamase  24.93 
 
 		 713 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619685  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  28.05 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2587  putative penicillin-binding protein  26.32 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35213e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2316  penicillin-binding protein  26.02 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181197  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  26.8 
 
 		 462 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  28.05 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  26.33 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  25.96 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.45 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  26.39 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0116  beta-lactamase  27.65 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  27.18 
 
 		 353 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  28.88 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01828  beta-lactamase precursor  27.54 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.284204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  26.24 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2953  beta-lactamase  28.94 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.46 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  29.63 
 
 		 590 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3518  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  30.43 
 
 		 508 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>