More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3266 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0756  beta-lactamase  94.59 
 
 		 394 aa  721    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.337728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3266  beta-lactamase  100 
 
 		 397 aa  798    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3369  beta-lactamase  89.67 
 
 		 397 aa  680    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0914  hypothetical protein  79.8 
 
 		 398 aa  634  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0856  beta-lactamase  77.83 
 
 		 399 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0904  beta-lactamase  56.29 
 
 		 374 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3516  beta-lactamase  58.97 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3184  beta-lactamase  38.08 
 
 		 389 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2964  beta-lactamase  33.75 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2619  hypothetical protein  31.36 
 
 		 349 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606366  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  30.17 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  29.69 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.63 
 
 		 487 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  24.93 
 
 		 578 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  23.94 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  24.62 
 
 		 446 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  25.72 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  26.51 
 
 		 449 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  25.59 
 
 		 413 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  23.73 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  26.07 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2019  fmtA-like protein  25.19 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.15249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.77 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.92 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  27.02 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  25.31 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  25.77 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  25.77 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  25.39 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  25.85 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  25.77 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  27.36 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  27.33 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  25.31 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  27.34 
 
 		 321 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  28.62 
 
 		 530 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  27.72 
 
 		 366 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  25.35 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  25.16 
 
 		 720 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  23.74 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  23.74 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  23.74 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.22 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  24.92 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.4 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  23.48 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  26.81 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  26.71 
 
 		 590 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  27.46 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  25.98 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  24.92 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.26 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  25.42 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  23.42 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  24.4 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  24.6 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  23.27 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  23.93 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  23.48 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.16 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  24.05 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  23.23 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  24.53 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  25.71 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  23.75 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.74 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  21.45 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  25.26 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  27.24 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.91 
 
 		 2457 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  24.4 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  22.98 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  29 
 
 		 966 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  25.38 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.24 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.67 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  24.57 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  23.41 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  29.11 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  24.4 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1788  beta-lactamase  25.94 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.358741  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  24.56 
 
 		 510 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  25.42 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  24.35 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  27.69 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  23.54 
 
 		 388 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2068  beta-lactamase  25.28 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.567046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.91 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.96 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.05 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  22.15 
 
 		 342 aa  66.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  24.57 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  23.86 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  24.05 
 
 		 385 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1968  beta-lactamase  25.82 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  25.96 
 
 		 662 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  27.27 
 
 		 364 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  28.22 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.16 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2459  beta-lactamase  23.89 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>