More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3184 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3184  beta-lactamase  100 
 
 
389 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0914  hypothetical protein  39.71 
 
 
398 aa  257  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0904  beta-lactamase  37.8 
 
 
374 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0756  beta-lactamase  39.83 
 
 
394 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.337728  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3266  beta-lactamase  37.95 
 
 
397 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0856  beta-lactamase  38.1 
 
 
399 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3369  beta-lactamase  38.35 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3516  beta-lactamase  41.74 
 
 
465 aa  206  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2964  beta-lactamase  36.14 
 
 
380 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2619  hypothetical protein  32.48 
 
 
349 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606366  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  29.05 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  25.58 
 
 
345 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  27.49 
 
 
487 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  26.42 
 
 
380 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  25.23 
 
 
476 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  24.36 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  27.18 
 
 
389 aa  83.6  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  25.8 
 
 
451 aa  82  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  27.54 
 
 
429 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.01 
 
 
578 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  26.44 
 
 
530 aa  80.1  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  23.34 
 
 
497 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.09 
 
 
438 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0343  beta-lactamase  22.42 
 
 
482 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  23.88 
 
 
417 aa  76.6  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  25.17 
 
 
848 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  25 
 
 
428 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  23.66 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  22.78 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.72 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  25.84 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0498  beta-lactamase  27.34 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.472446  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  26.46 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.37 
 
 
434 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  23.74 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  25.26 
 
 
450 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  26.97 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  24.44 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  26.49 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.84 
 
 
429 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  23.74 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  23.33 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1164  beta-lactamase  24.25 
 
 
501 aa  69.7  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1551  beta-lactamase  24.02 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  0.407276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  25.09 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.21 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  21.53 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  24.39 
 
 
442 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3287  beta-lactamase  22.15 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0209216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  22.64 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  24.28 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7012  beta-lactamase  23.77 
 
 
467 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.858592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.14 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  33.58 
 
 
455 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4308  beta-lactamase  26.06 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0244726  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  23.45 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  23.34 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  24.57 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  22.59 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  24.05 
 
 
513 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  27.31 
 
 
449 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  26.55 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4863  beta-lactamase  23.22 
 
 
441 aa  67  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.625101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  24.29 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0318  beta-lactamase  24.72 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.180634 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  25.5 
 
 
371 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.88 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.88 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  30.25 
 
 
2457 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.88 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  24.67 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.32 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  30.46 
 
 
611 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  24.34 
 
 
524 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  22.91 
 
 
381 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  23.19 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  23.77 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  23.77 
 
 
340 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3187  beta-lactamase  22.36 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000216369  hitchhiker  0.000000000911992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  23.29 
 
 
616 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  23.49 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  33.59 
 
 
464 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  24.11 
 
 
409 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.01 
 
 
421 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.34 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  24.01 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  24.01 
 
 
412 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2881  beta-lactamase  25.57 
 
 
338 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.74645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  24.06 
 
 
340 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  23.43 
 
 
341 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  24.34 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  24.01 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  23.17 
 
 
343 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  26.79 
 
 
381 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  23.68 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  29.8 
 
 
593 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  25.37 
 
 
361 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  26.21 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  23.33 
 
 
451 aa  62.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  33.07 
 
 
364 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>