More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0904 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0904  beta-lactamase  100 
 
 		 374 aa  762    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0914  hypothetical protein  57.61 
 
 		 398 aa  391  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0856  beta-lactamase  56.43 
 
 		 399 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0756  beta-lactamase  55.29 
 
 		 394 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.337728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3266  beta-lactamase  56.67 
 
 		 397 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3369  beta-lactamase  57.27 
 
 		 397 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3516  beta-lactamase  72.61 
 
 		 465 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3184  beta-lactamase  37.8 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2964  beta-lactamase  34.13 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2619  hypothetical protein  33.01 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606366  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5107  beta-lactamase  29.52 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434559  normal  0.256673 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4697  beta-lactamase  32.28 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.168974  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2294  penicillin-binding protein, putative  28.11 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.272122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.17 
 
 		 487 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  28.53 
 
 		 578 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  27.73 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2923  beta-lactamase  26.43 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.93 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  30.53 
 
 		 450 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0468  beta-lactamase  25.58 
 
 		 455 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000926021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1777  beta-lactamase  27.19 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00484911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  23.62 
 
 		 476 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  27.42 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  25 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.77 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  28.21 
 
 		 848 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.71 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1072  Beta-lactamase  25.13 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  27.04 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0428  beta-lactamase  24.38 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.354595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5985  beta-lactamase  24.48 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  26.87 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.08 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  24.48 
 
 		 513 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  26.89 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2616  beta-lactamase  27.48 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  26.53 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  25.9 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  27.85 
 
 		 347 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0126  beta-lactamase  25.33 
 
 		 456 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3144  beta-lactamase  25.56 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  26.15 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  26.3 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  25.98 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  25.98 
 
 		 348 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  27.84 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  24.54 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2921  beta-lactamase class C-like protein  27.25 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0505  putative penicillin-binding protein  24.4 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0859162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1520  Beta-lactamase  25.08 
 
 		 537 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000638983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  27.27 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  26.02 
 
 		 410 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37770  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  24.17 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.269534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  25.69 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  25.86 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0555  penicillin-binding protein, putative  24.4 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2357  beta-lactamase  24.93 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  26.06 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3512  beta-lactamase  31.28 
 
 		 364 aa  74.7  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0558  putative penicillin-binding protein  24.4 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.622752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  26.06 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0201  beta-lactamase  25.35 
 
 		 530 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.494145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  26.13 
 
 		 478 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2259  beta-lactamase  30.89 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.296569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0419  beta-lactamase  24.06 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  24.49 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  26.44 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  26.39 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  24.56 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0471  beta-lactamase  23.45 
 
 		 616 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0939  beta-lactamase  23.91 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.18746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4818  putative penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.618322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1311  beta-lactamase  23.41 
 
 		 669 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2968  beta-lactamase  23.8 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.57 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3175  beta-lactamase  26.28 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  26.11 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5243  beta-lactamase  25.22 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  27.21 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  24.3 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0416  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.1 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0430511  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  24.1 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  24.3 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4213  beta-lactamase  24.3 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  28.64 
 
 		 422 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3422  beta-lactamase  24 
 
 		 593 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.126074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  32.26 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0412  beta-lactamase (penicillin-binding protein) (penicillinase)  24.1 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  25.9 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  25.38 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3615  beta-lactamase  23.64 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  29.03 
 
 		 449 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3731  beta-lactamase  24.05 
 
 		 603 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.227339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4152  beta-lactamase  23.48 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  23.36 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  25.4 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  25.37 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0999  beta-lactamase  26.92 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0117018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  26.35 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2717  beta-lactamase  22.37 
 
 		 470 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>