69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4395 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  50.68 
 
 		 316 aa  300  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  31.8 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  31.95 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  27.64 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.3 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  29.32 
 
 		 288 aa  119  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  29.81 
 
 		 789 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  28.98 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  33.86 
 
 		 640 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  31.31 
 
 		 670 aa  97.8  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  28.26 
 
 		 631 aa  97.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  32.46 
 
 		 519 aa  92.8  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  32.11 
 
 		 704 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  28.4 
 
 		 631 aa  90.9  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  26.72 
 
 		 658 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  28.42 
 
 		 673 aa  89  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  31.53 
 
 		 669 aa  89  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.04 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  27.68 
 
 		 509 aa  79.7  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  24.73 
 
 		 638 aa  79  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.05 
 
 		 673 aa  77.8  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.95 
 
 		 630 aa  75.9  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  25.93 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  29.07 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  26.34 
 
 		 525 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  31.38 
 
 		 672 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  25.17 
 
 		 656 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  29.41 
 
 		 620 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  27.73 
 
 		 761 aa  69.3  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  29.9 
 
 		 471 aa  69.3  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  28.12 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  24.49 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  24.73 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.9 
 
 		 665 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  29.49 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.75 
 
 		 645 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  28.05 
 
 		 757 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  26.51 
 
 		 677 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  22.75 
 
 		 712 aa  59.7  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  25.37 
 
 		 712 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  29.53 
 
 		 813 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  25.76 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.1 
 
 		 656 aa  57.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  23.53 
 
 		 648 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  24.19 
 
 		 510 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  30.89 
 
 		 679 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  26.69 
 
 		 504 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  23.98 
 
 		 778 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  27.94 
 
 		 798 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.04 
 
 		 668 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  32.56 
 
 		 776 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  26.71 
 
 		 650 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  26.67 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  27.21 
 
 		 642 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  25.56 
 
 		 344 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  29.41 
 
 		 626 aa  50.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 586 aa  49.7  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  35.63 
 
 		 517 aa  49.3  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.82 
 
 		 585 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  23.58 
 
 		 734 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  31.54 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  26.96 
 
 		 903 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 		 594 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  27.01 
 
 		 643 aa  46.6  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  28.1 
 
 		 671 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.56 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 		 613 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>