54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2161 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 344 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  38.3 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  32.39 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  44.58 
 
 		 757 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  41.98 
 
 		 798 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 658 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 813 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  29.28 
 
 		 631 aa  63.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  28.3 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  41.3 
 
 		 471 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  38.82 
 
 		 656 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  26.92 
 
 		 638 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  40.74 
 
 		 641 aa  59.7  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 778 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  27.86 
 
 		 631 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  43.42 
 
 		 734 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  38.37 
 
 		 677 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_002950  PG1372  hypothetical protein  27.36 
 
 		 473 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.163525 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  31.65 
 
 		 519 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.66 
 
 		 645 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  40.54 
 
 		 525 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  34.95 
 
 		 630 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.71 
 
 		 673 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  41.56 
 
 		 585 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  31.48 
 
 		 586 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  25.4 
 
 		 712 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 537 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  28.93 
 
 		 672 aa  49.3  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  28.21 
 
 		 626 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  28.08 
 
 		 642 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  28.02 
 
 		 648 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  38.67 
 
 		 679 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  37.14 
 
 		 504 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.9 
 
 		 665 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  37.89 
 
 		 710 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  30 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  30.92 
 
 		 650 aa  46.2  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  34.09 
 
 		 673 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  30 
 
 		 712 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  26.06 
 
 		 640 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  29.33 
 
 		 653 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  32.32 
 
 		 656 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  41.82 
 
 		 669 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 660 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  41.07 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  36 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  32.93 
 
 		 903 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  37.31 
 
 		 789 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  28.67 
 
 		 594 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  32.56 
 
 		 300 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  38.6 
 
 		 510 aa  43.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.48 
 
 		 613 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>