51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1161 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  36.13 
 
 
798 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  26.85 
 
 
734 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 
631 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  32.1 
 
 
813 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.21 
 
 
665 aa  66.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.3 
 
 
673 aa  66.2  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  34.38 
 
 
638 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.71 
 
 
519 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  28.76 
 
 
640 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  25.41 
 
 
509 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.22 
 
 
585 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 
757 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  30.18 
 
 
668 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  30.77 
 
 
626 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  32.09 
 
 
658 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  29.05 
 
 
316 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  30.22 
 
 
643 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  26.04 
 
 
517 aa  56.2  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  31.46 
 
 
648 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.7 
 
 
653 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  32.41 
 
 
504 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  24.73 
 
 
613 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  28.81 
 
 
903 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  23.94 
 
 
677 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  24.57 
 
 
656 aa  53.5  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  23.73 
 
 
712 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  24.92 
 
 
641 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2689  WD40 domain protein beta Propeller  26.34 
 
 
339 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612701  normal  0.326284 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  25.69 
 
 
645 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.46 
 
 
537 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  25.56 
 
 
300 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  28.12 
 
 
650 aa  50.1  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.22 
 
 
660 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.08 
 
 
631 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  39.24 
 
 
263 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.52 
 
 
671 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  27 
 
 
789 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1372  hypothetical protein  38.64 
 
 
473 aa  47.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.163525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  25.08 
 
 
630 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  27.49 
 
 
642 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.26 
 
 
648 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  30.77 
 
 
510 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  37.18 
 
 
293 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  27.01 
 
 
670 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  23.2 
 
 
525 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  25 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  23.55 
 
 
620 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  31.31 
 
 
297 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  28.77 
 
 
586 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  27.08 
 
 
630 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>