49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1372 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1372  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  968    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.163525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  23.87 
 
 
658 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  35.24 
 
 
734 aa  67  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  22.37 
 
 
631 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  36.96 
 
 
263 aa  63.2  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  30.48 
 
 
620 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  26.59 
 
 
585 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  31.29 
 
 
638 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
757 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 
798 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  36.73 
 
 
648 aa  57.4  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.56 
 
 
673 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2161  WD40 domain protein beta Propeller  27.36 
 
 
344 aa  54.7  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.143673  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  34.41 
 
 
640 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  33.05 
 
 
630 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  30.77 
 
 
471 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.28 
 
 
656 aa  53.5  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 
645 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  35.11 
 
 
642 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 
813 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  33.33 
 
 
626 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.89 
 
 
510 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.33 
 
 
653 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  28.33 
 
 
660 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  28.85 
 
 
650 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  34.41 
 
 
656 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  29.7 
 
 
594 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  29.81 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.5 
 
 
679 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  26.43 
 
 
648 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  25.96 
 
 
586 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  37.33 
 
 
519 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
668 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 
643 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  31.43 
 
 
613 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1161  hypothetical protein  38.64 
 
 
344 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
385 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  38.96 
 
 
243 aa  47  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 
671 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  29.63 
 
 
293 aa  46.6  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  31.58 
 
 
666 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  28.18 
 
 
641 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3772  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
562 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  30.63 
 
 
712 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  32.22 
 
 
903 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  31.19 
 
 
631 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  28.03 
 
 
630 aa  43.9  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  36.62 
 
 
537 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
810 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>