32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0439 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  100 
 
 
306 aa  629  1e-179  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  54.44 
 
 
299 aa  312  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  31.66 
 
 
296 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  30.66 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  31.16 
 
 
285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  29.62 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  29.77 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.42 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  29.35 
 
 
309 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  24.84 
 
 
789 aa  77.8  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  30.77 
 
 
525 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.46 
 
 
537 aa  72.4  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  27.36 
 
 
669 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  27.42 
 
 
673 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  30.05 
 
 
670 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  40.51 
 
 
694 aa  57.4  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  24.54 
 
 
761 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  52.27 
 
 
519 aa  55.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  23.35 
 
 
704 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  44.44 
 
 
776 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  29.75 
 
 
656 aa  52.4  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  28.29 
 
 
620 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.78 
 
 
641 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  47.73 
 
 
510 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  23.08 
 
 
517 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  40 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  24.34 
 
 
631 aa  44.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
630 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  26.67 
 
 
504 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  37.31 
 
 
648 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  36.96 
 
 
672 aa  43.5  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  19.41 
 
 
658 aa  42.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.973049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>