33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4001 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0439  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  54.44 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00226891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4002  hypothetical protein  37.58 
 
 		 285 aa  175  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2087  hypothetical protein  35.13 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1660  hypothetical protein  33.22 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0438  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  34.28 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000271356  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  28.87 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  29.81 
 
 		 316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1824  WD40 domain-containing protein  28.62 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  27.48 
 
 		 673 aa  95.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28.64 
 
 		 525 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1845  WD40 domain-containing protein  24.83 
 
 		 789 aa  79.3  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.418755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  30.58 
 
 		 537 aa  79.3  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  29 
 
 		 669 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  24.51 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  25.98 
 
 		 694 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.87 
 
 		 670 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  29.35 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  25.68 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  25.25 
 
 		 519 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.82 
 
 		 631 aa  56.6  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1823  hypothetical protein  25.38 
 
 		 761 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  29.31 
 
 		 504 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  22.34 
 
 		 673 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  26.6 
 
 		 656 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  27.73 
 
 		 585 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  26.72 
 
 		 630 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  26.37 
 
 		 641 aa  46.2  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  23.35 
 
 		 517 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  24.58 
 
 		 631 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0562  WD40 domain-containing protein  25.23 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  30.67 
 
 		 638 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  19.82 
 
 		 658 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>