205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4036 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  100 
 
 		 118 aa  246  8e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  44.07 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  43.7 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  41.59 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  43.59 
 
 		 127 aa  83.6  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  38.98 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  42.74 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  40.68 
 
 		 117 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  37.61 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  41.53 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  38.79 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  41.07 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.75 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  38.05 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  43 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  38.6 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  37.72 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  36.84 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  44.21 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.58 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  36.27 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  38.66 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  35.04 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  34.51 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  35.71 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  40.34 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  34.48 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  36.36 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  38.05 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10390  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  39.58 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000139118  unclonable  0.000000000910029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  37.93 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  36.75 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  36.67 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  38.14 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  38.05 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  37.14 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  36.45 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  40.35 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  40.35 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  36.46 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  40.62 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  37.74 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  37.17 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  39.29 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  35.04 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1723  hypothetical protein  35.45 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  37.11 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  36.63 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  32.74 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  36.11 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0676  hypothetical protein  33.91 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  35.59 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  32.14 
 
 		 115 aa  61.6  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  38.79 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2398  hypothetical protein  38.54 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.430013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  36.45 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  31.3 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  35.78 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  32.14 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1703  hypothetical protein  35.34 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  35.19 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4140  hypothetical protein  28.7 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2303  hypothetical protein  35.77 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0306992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2007  hypothetical protein  39.8 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.63182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  34.34 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  35.64 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  34.04 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3586  hypothetical protein  32.2 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0700  protein of unknown function UPF0102  37.39 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000202877  hitchhiker  0.000000354886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2202  hypothetical protein  29.2 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.474644  normal  0.174288 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.91 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  36.7 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12912  hypothetical protein  32.2 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0199208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  36.28 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0145  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0280805  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  34.26 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1985  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0318406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2031  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  30.36 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3123  protein of unknown function UPF0102  32.79 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308676  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  29.41 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1965  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.52969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0910  hypothetical protein  31.09 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  33.87 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0546  hypothetical protein  32.43 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.672576  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2193  hypothetical protein  37.5 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  33.66 
 
 		 143 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1641  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0797113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  31.68 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0231  protein of unknown function UPF0102  34.74 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.819406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  33.62 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1934  hypothetical protein  32.99 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.547856  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2103  hypothetical protein  35.14 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.374615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>