More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2079 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2079  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 381 aa  786    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6426  anti-FecI sigma factor, FecR  43.72 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0583598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2672  anti-FecI sigma factor, FecR  43.41 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5148  anti-FecI sigma factor, FecR  48.58 
 
 		 413 aa  285  8e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114166  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5341  anti-FecI sigma factor, FecR  43.51 
 
 		 385 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150121  normal  0.0523863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3047  anti-FecI sigma factor, FecR  40.84 
 
 		 397 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6156  anti-FecI sigma factor, FecR  39.8 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.654672  normal  0.21983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1120  FecR protein  38.07 
 
 		 382 aa  262  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  hitchhiker  0.0000759776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2948  anti-FecI sigma factor, FecR  40 
 
 		 398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.522825  normal  0.183052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4498  anti-FecI sigma factor, FecR  37.53 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.388075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6732  anti-FecI sigma factor, FecR  39.39 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000497834  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6741  anti-FecI sigma factor, FecR  40.1 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5112  anti-FecI sigma factor, FecR  42.11 
 
 		 405 aa  239  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.312016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2882  anti-FecI sigma factor, FecR  37.85 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0955  FecR protein  36.88 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1382  FecR protein  35.5 
 
 		 398 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1585  anti-FecI sigma factor, FecR  36.67 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2250  FecR protein  36.2 
 
 		 394 aa  232  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1381  anti-FecI sigma factor, FecR  35.37 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0722919  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0724  FecR protein  35.26 
 
 		 391 aa  222  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1767  anti-FecI sigma factor, FecR  36.32 
 
 		 398 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3803  anti-FecI sigma factor, FecR  35.34 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2711  FecR protein  40.37 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2894  FecR protein  33.5 
 
 		 389 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0304  FecR protein  36.2 
 
 		 386 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2108  anti-FecI sigma factor, FecR  41 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.748134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0709  FecR protein  35.1 
 
 		 398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0327  FecR protein  42.81 
 
 		 388 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4177  anti-FecI sigma factor, FecR  35.38 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.0322229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0715  anti-FecI sigma factor, FecR  36.13 
 
 		 394 aa  212  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372479  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2284  FecR protein  35.04 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3383  FecR protein  41.75 
 
 		 375 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2245  FecR protein  42.01 
 
 		 396 aa  208  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4547  anti-FecI sigma factor, FecR  36.36 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.719196  normal  0.0835387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1501  FecR protein  34.99 
 
 		 375 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000718034  normal  0.0874984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2138  FecR protein  37.65 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3997  FecR protein  34.26 
 
 		 377 aa  202  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0949  FecR protein  37.73 
 
 		 372 aa  201  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  0.208289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0442  FecR protein  34.72 
 
 		 390 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2646  FecR protein  33.25 
 
 		 383 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1363  FecR protein  36 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.864118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3790  FecR protein  33.77 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3967  FecR protein  33.5 
 
 		 385 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2531  FecR protein  34.17 
 
 		 390 aa  189  8e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2853  FecR protein  40.07 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.184226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4659  anti-FecI sigma factor, FecR  35.74 
 
 		 430 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000347403  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2723  FecR protein  38.54 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1990  FecR protein  45.12 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328209  hitchhiker  0.0000107473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1355  anti-FecI sigma factor, FecR  39.1 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4608  anti-FecI sigma factor, FecR  33.58 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2856  anti-FecI sigma factor, FecR  37.33 
 
 		 378 aa  176  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.183412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3150  FecR protein  30.6 
 
 		 389 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0892633  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3990  FecR protein  33.67 
 
 		 367 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0904  FecR protein  31.17 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.585721  hitchhiker  0.000263319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1073  FecR protein  30.51 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.356494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1660  FecR protein  32.35 
 
 		 408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1799  FecR protein  35.64 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1982  FecR protein  37.17 
 
 		 402 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  hitchhiker  0.000000845336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3173  FecR protein  32.71 
 
 		 379 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0630959  normal  0.799591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3391  FecR protein  30.68 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.335888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1037  FecR protein  34.22 
 
 		 408 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1242  FecR protein  37.56 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2375  FecR protein  30.36 
 
 		 412 aa  139  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0596034  normal  0.112561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3977  anti-FecI sigma factor, FecR  31.58 
 
 		 386 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.658799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3160  anti-FecI sigma factor, FecR  32.73 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00013248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3158  anti-FecI sigma factor, FecR  29.03 
 
 		 383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000049717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3287  anti-FecI sigma factor, FecR  41.1 
 
 		 384 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313343  hitchhiker  0.00186616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0045  anti-FecI sigma factor, FecR  28.24 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3336  anti-FecI sigma factor, FecR  30.46 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0971  anti-FecI sigma factor, FecR  29.14 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1405  anti-FecI sigma factor, FecR  27.91 
 
 		 407 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2262  anti-FecI sigma factor, FecR  27.61 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1214  anti-FecI sigma factor, FecR  28.61 
 
 		 392 aa  125  9e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.838522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3220  anti-FecI sigma factor, FecR  30.18 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0139  anti-FecI sigma factor, FecR  32.41 
 
 		 381 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2355  FecR protein  38.89 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204979  normal  0.538209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3946  anti-FecI sigma factor, FecR  31.34 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2007  anti-FecI sigma factor, FecR  27.01 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.94073  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3252  anti-FecI sigma factor, FecR  35.37 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.451984  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5563  anti-FecI sigma factor, FecR  28.67 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0103518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7183  anti-FecI sigma factor, FecR  30.4 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3600  anti-FecI sigma factor, FecR  25.45 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000104392  hitchhiker  0.000024232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3198  anti-FecI sigma factor, FecR  26.72 
 
 		 380 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.694273 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2668  FecR protein  31.63 
 
 		 361 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.153362  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1889  anti-FecI sigma factor, FecR  32.31 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1728  anti-FecI sigma factor, FecR  28.77 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6567  anti-FecI sigma factor, FecR  25.64 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0766801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1280  FecR protein  31.66 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3692  FecR protein  25.74 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.172951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2830  anti-FecI sigma factor, FecR  26.74 
 
 		 345 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3806  anti-FecI sigma factor, FecR  27.97 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.769351  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3232  anti-FecI sigma factor, FecR  30.84 
 
 		 313 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0188586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2094  anti-FecI sigma factor, FecR  25.27 
 
 		 374 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2437  anti-FecI sigma factor, FecR  25.26 
 
 		 344 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1149  anti-FecI sigma factor, FecR  29.59 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0373323  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2374  anti-FecI sigma factor, FecR  32.98 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3204  anti-FecI sigma factor, FecR  23.72 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.619399  normal  0.25037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0059  anti-FecI sigma factor, FecR  28.06 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1588  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 337 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.313513 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3858  anti-FecI sigma factor, FecR  35.45 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>