More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1159 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  100 
 
 		 215 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  68.9 
 
 		 218 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  61.4 
 
 		 224 aa  292  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  63.33 
 
 		 225 aa  289  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  60 
 
 		 215 aa  280  8.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  58.88 
 
 		 220 aa  274  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0620  hypothetical protein  50.95 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  53.12 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  47.06 
 
 		 220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  46.08 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  46.86 
 
 		 209 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  45.81 
 
 		 213 aa  192  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  49.3 
 
 		 212 aa  193  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  46.38 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  44.44 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0915  endonuclease III  50.25 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.603627  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  44.61 
 
 		 211 aa  187  8e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  45.59 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  44.86 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  42.99 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  42.99 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  42.99 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  42.99 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  42.99 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.29 
 
 		 218 aa  185  4e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  42.25 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0512  endonuclease III  47.57 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  42.99 
 
 		 215 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  43.69 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  41.75 
 
 		 212 aa  184  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  43.63 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  42.06 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  43.2 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  43.2 
 
 		 215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  46.15 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  46.7 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  44.33 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  47.52 
 
 		 233 aa  181  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  45.54 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  42.06 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  43.2 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  43.2 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1341  endonuclease III  48.99 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  43.75 
 
 		 213 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  45.18 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  41.38 
 
 		 217 aa  179  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  43.5 
 
 		 212 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  45.85 
 
 		 286 aa  178  4.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  44.95 
 
 		 248 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  44.95 
 
 		 260 aa  178  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  41.31 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.54 
 
 		 219 aa  178  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  46.34 
 
 		 215 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  43 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.73 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.63 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  43.06 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  43.2 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  42.93 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  43.94 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  42.72 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.93 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  44.44 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  43.48 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  43.43 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  48.13 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  45.5 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.5 
 
 		 219 aa  175  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  43.43 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  43.14 
 
 		 212 aa  175  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  43.58 
 
 		 224 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.96 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  43.37 
 
 		 208 aa  174  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  45.95 
 
 		 197 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  42.03 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  43.56 
 
 		 211 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.78 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0698  endonuclease III  46.94 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  40.38 
 
 		 210 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  43 
 
 		 335 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  41.58 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  40.85 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  42.08 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  47.29 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  42.31 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1074  endonuclease III  46.43 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.497275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.22 
 
 		 258 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  44.22 
 
 		 261 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  43.63 
 
 		 236 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  44.93 
 
 		 222 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  44.17 
 
 		 234 aa  171  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  40.19 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  45.54 
 
 		 240 aa  171  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  44.85 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  42.35 
 
 		 225 aa  170  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  45.45 
 
 		 225 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  43.35 
 
 		 285 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  42.23 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>