54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0461 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0461  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 765 aa  1566    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5163  two component regulator propeller domain protein  31.69 
 
 		 774 aa  284  5.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.522129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3302  surface antigen  28.91 
 
 		 756 aa  270  8.999999999999999e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0707  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.24 
 
 		 760 aa  255  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  27.94 
 
 		 775 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1604  immunoreactive 84 kDa antigen PG93  27.31 
 
 		 776 aa  217  5.9999999999999996e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02505  immunoreactive 84 kDa antigen  25.55 
 
 		 761 aa  209  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4547  hypothetical protein  29.94 
 
 		 608 aa  194  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  25.17 
 
 		 1250 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4114  two component regulator propeller domain-containing protein  25.49 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0168145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  24.05 
 
 		 1366 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  25.08 
 
 		 976 aa  58.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  24.14 
 
 		 1397 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  22.51 
 
 		 1378 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 1079 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.91 
 
 		 965 aa  53.9  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.12 
 
 		 1374 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  22.15 
 
 		 1053 aa  53.5  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  25.45 
 
 		 1118 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  25.36 
 
 		 987 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  23.7 
 
 		 1370 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  21.9 
 
 		 1316 aa  52  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  21.2 
 
 		 1498 aa  51.6  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  22.22 
 
 		 695 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  22.09 
 
 		 1084 aa  50.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  31.65 
 
 		 1017 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  25.58 
 
 		 359 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  23.71 
 
 		 1008 aa  50.1  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  23.63 
 
 		 1054 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  27.95 
 
 		 1363 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  30.41 
 
 		 1185 aa  48.9  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  25.73 
 
 		 692 aa  48.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  22.31 
 
 		 1306 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  25.21 
 
 		 1407 aa  47.8  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  23.93 
 
 		 1347 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  23.63 
 
 		 1105 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.02 
 
 		 1093 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  23.7 
 
 		 1070 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.96 
 
 		 1226 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  25.58 
 
 		 1051 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  22.27 
 
 		 386 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  27.84 
 
 		 1418 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  22.37 
 
 		 1005 aa  45.8  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  30.16 
 
 		 1175 aa  45.8  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.17 
 
 		 1242 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 1453 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  26.52 
 
 		 1388 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  24.69 
 
 		 1340 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 1237 aa  45.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.87 
 
 		 1373 aa  45.1  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  22.45 
 
 		 1346 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  24.8 
 
 		 1313 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  24.49 
 
 		 1374 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  22.08 
 
 		 1334 aa  44.3  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>