103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0381 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
187 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0312  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  58.92 
 
 
185 aa  218  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.955196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0410  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  57.69 
 
 
182 aa  201  6e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  53.3 
 
 
196 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1448  outer membrane protein OmpH  49.15 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0414  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  44.26 
 
 
196 aa  158  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.236191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  42.16 
 
 
184 aa  142  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1958  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.86 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3413  ompH family outer membrane protein  28.07 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0192  cationic outer membrane protein OmpH  24.07 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.65 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1121  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.1 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00845526 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04310  cationic outer membrane protein precursor  25.88 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.14 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.39 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000199693  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.39 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.39 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000751414  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.77 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.99 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000722219  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1359  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.34 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1053  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.093719  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.39 
 
 
166 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000377724  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.16 
 
 
165 aa  60.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000425102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4389  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.31 
 
 
211 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00195183  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.01 
 
 
168 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.59 
 
 
165 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000429908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1688  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.1 
 
 
167 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0193  cationic outer membrane protein OmpH  29.73 
 
 
163 aa  58.2  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.757024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1054  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.67 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14055  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4436  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  33.59 
 
 
221 aa  57.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0988  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.68 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  26.71 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.71 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.71 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000309047  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.71 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000137224  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.97 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000628638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.88 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0783  hypothetical protein  25.5 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2267  outer membrane protein, putative  28.24 
 
 
172 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  29.14 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  28.49 
 
 
165 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0987  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  21.82 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2230  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.79 
 
 
179 aa  54.3  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  26.01 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000604382  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  25.3 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000291301  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  25.3 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  27.59 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3414  ompH family outer membrane protein  29.73 
 
 
216 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.556312  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.03 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0049551  normal  0.392772 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  24.55 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1689  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24 
 
 
341 aa  52  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1252  outer membrane protein  26.62 
 
 
171 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000206392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2356  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.04 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3415  ompH family outer membrane protein  29.2 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3236  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.07 
 
 
174 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00411052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  27.56 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  26.35 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038296  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  27.56 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000698403  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  27.56 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0761  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.6 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00282241  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0840  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.37 
 
 
171 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.51 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4435  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  22.09 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3420  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.37 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.74 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  26.32 
 
 
169 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0682  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.99 
 
 
146 aa  48.5  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.14 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00455548  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04305  putative outer membrane protein  27.34 
 
 
169 aa  48.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3263  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.05 
 
 
170 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1543  outer membrane protein OmpH, putative  27.49 
 
 
167 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.767097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3018  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
175 aa  47  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0147625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  24.46 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0818  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.95 
 
 
139 aa  47.4  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.78632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  28.85 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  28.12 
 
 
165 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1352  Outer membrane protein (OmpH-like)  32.58 
 
 
159 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.84 
 
 
171 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4073  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.46 
 
 
167 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08486  cationic outer membrane protein OmpH  26.21 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.9 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1492  hypothetical protein  22.78 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.9 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1141  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1210  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1863  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.58 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  24.1 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  24.1 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.4 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1082  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.32 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17170  hypothetical protein  22.78 
 
 
168 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4390  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.15 
 
 
214 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000436364  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0834  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  23.03 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3380  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.84 
 
 
171 aa  42.4  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  23.35 
 
 
164 aa  42  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000710981  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2843  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.81 
 
 
178 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  23.43 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  23.43 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  23.43 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>