257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2025 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2025  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02085  hypothetical protein  52.94 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.997348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1217  hypothetical protein  47.15 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266389  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0277  protein of unknown function UPF0102  47.9 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.107261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5877  protein of unknown function UPF0102  43.97 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.662779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3709  protein of unknown function UPF0102  45.3 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0701  hypothetical protein  43.48 
 
 		 122 aa  97.1  8e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0017  hypothetical protein  42.37 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0017  hypothetical protein  39.5 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00052241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1475  endonuclease  39.13 
 
 		 115 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.733308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2864  hypothetical protein  38.98 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00415914  hitchhiker  0.000000500394 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3311  protein of unknown function UPF0102  35.96 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07400  hypothetical protein  43.59 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1792  hypothetical protein  33.62 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2230  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0169041  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1992  hypothetical protein  33.9 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3756  hypothetical protein  36.75 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1530  hypothetical protein  39.66 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0048655  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2881  hypothetical protein  32.43 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.696458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0465  hypothetical protein  38.14 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1874  hypothetical protein  34.51 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0294  hypothetical protein  40.38 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3248  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.852323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1228  hypothetical protein  34.82 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.260342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3485  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000340579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3424  hypothetical protein  39.13 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0720  hypothetical protein  34.45 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0341617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1175  protein of unknown function UPF0102  30.19 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1406  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000418677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2217  hypothetical protein  31.53 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000089571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1093  endonuclease-like  33.33 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09830  conserved hypothetical protein TIGR00252  35.71 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1959  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.142549  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1478  protein of unknown function UPF0102  37.5 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10043  normal  0.036198 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0037  hypothetical protein  35.04 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07020  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  36 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00114408  normal  0.507303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0993  protein of unknown function UPF0102  33.96 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00109853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1406  protein of unknown function UPF0102  31.63 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4252  hypothetical protein  36.56 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2148  hypothetical protein  31.82 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0629  hypothetical protein  35.54 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1272  protein of unknown function UPF0102  33.06 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1320  hypothetical protein  33.05 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1836  hypothetical protein  34.31 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2019  protein of unknown function UPF0102  30.17 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.573307  normal  0.167847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1910  hypothetical protein  35.14 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.179028  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1677  hypothetical protein  35 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.238653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.197298  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2095  protein of unknown function UPF0102  33.68 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2474  hypothetical protein  34 
 
 		 118 aa  67  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0253334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1186  hypothetical protein  34.48 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2213  hypothetical protein  33.96 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000124547 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0758  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0650  hypothetical protein  38.38 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1376  protein of unknown function UPF0102  36.28 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000032081  normal  0.333882 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2488  protein of unknown function UPF0102  30 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0776001  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1447  protein of unknown function UPF0102  31.67 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0702  hypothetical protein  38.38 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1947  hypothetical protein  31 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.439621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2298  hypothetical protein  34.55 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3998  protein of unknown function UPF0102  29.82 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1218  protein of unknown function UPF0102  34.74 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.648075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4188  hypothetical protein  31.82 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1969  hypothetical protein  34.55 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00399816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4070  hypothetical protein  31.82 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3990  hypothetical protein  31.82 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2054  hypothetical protein  34.55 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.595954  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1291  protein of unknown function UPF0102  30.77 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000677509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4100  hypothetical protein  31.82 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0251  hypothetical protein  31.03 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0666  hypothetical protein  34.58 
 
 		 116 aa  63.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0397911  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0992  hypothetical protein  30.97 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.528214  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3740  protein of unknown function UPF0102  34.86 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000086697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3985  hypothetical protein  31.3 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1407  protein of unknown function UPF0102  32.29 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.993674  normal  0.0549137 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_687  endonuclease  30.7 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2201  hypothetical protein  28.57 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0226  hypothetical protein  30.43 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113401  normal  0.113585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2035  hypothetical protein  36.36 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.848509  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11140  predicted endonuclease related to Holliday junction resolvase  28.7 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0330886  normal  0.323386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4036  protein of unknown function UPF0102  35.59 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261027  normal  0.0798574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0351  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0502533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09240  Holliday junction resolvase-like endonuclease  27.83 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0928499  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0216  hypothetical protein  40.59 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0669  hypothetical protein  29.59 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0016  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.204452  unclonable  0.000000883308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0977  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.320606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1156  hypothetical protein  32.38 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160558  normal  0.0576877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03356  Sigma-54 factor  31.07 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0460  protein of unknown function UPF0102  32.46 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3693  hypothetical protein  31.82 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2283  hypothetical protein  27.27 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1639  protein of unknown function UPF0102  38.14 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0781  hypothetical protein  28.95 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0553  protein of unknown function UPF0102  29.63 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.156898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3685  hypothetical protein  30 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10070  conserved hypothetical protein TIGR00252  29.36 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0294595  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1550  hypothetical protein  30.33 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.176091 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0707  hypothetical protein  30.7 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1901  formate dehydrogenase H large subunit  38.38 
 
 		 109 aa  58.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>