215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1565 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.83 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.91 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  36.32 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.04 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.88 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  36.98 
 
 		 240 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  35.18 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  34.36 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.52 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  35.35 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.57 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  33.18 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  35.16 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  34.74 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  35.42 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  35.42 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  35.42 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  35.05 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  33.64 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.18 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  34.07 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.87 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.9 
 
 		 235 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  34.09 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  33.67 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  38.46 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.16 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.18 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.37 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  35.14 
 
 		 221 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  31.19 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  31.88 
 
 		 217 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.75 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.16 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  31.5 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.64 
 
 		 234 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.7 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.36 
 
 		 229 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.64 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.81 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  28.76 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.44 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  30.96 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.51 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.54 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.55 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  29.73 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.44 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.87 
 
 		 239 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.87 
 
 		 239 aa  96.3  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.61 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.04 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  33.85 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.56 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.57 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  30.48 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  32.43 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.68 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.18 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  31.91 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  29.41 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 229 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.81 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  34.55 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  29.29 
 
 		 213 aa  89  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  31.94 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  33.75 
 
 		 217 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  27.65 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  33.51 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.43 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.2 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.73 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.43 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  33.51 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.89 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 		 227 aa  85.5  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  37.21 
 
 		 236 aa  85.1  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  30.37 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  36.43 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  30.32 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  33.08 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  30.85 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.17 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  34.11 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  29 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  35.88 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>