66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3406 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3406  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 141 aa  273  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.698175 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5625  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0373202  normal  0.488111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5246  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.590424  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5334  MarR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.290903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 154 aa  50.8  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.11 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  19.67 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4346  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 142 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  32.67 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  26.92 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1826  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 258 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3253  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 163 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 148 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  45.45 
 
 		 148 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0775  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 159 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000196928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  41.54 
 
 		 157 aa  41.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  35.48 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  33.33 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 322 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  23.33 
 
 		 171 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 150 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>