More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1975 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1975  ABC transporter related protein  100 
 
 
279 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.122201  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2206  ABC transporter related  82.1 
 
 
271 aa  424  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3016  ABC transporter related  72.51 
 
 
260 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1228  ABC transporter related  67.32 
 
 
257 aa  360  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000178729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0105  ABC transporter related protein  73.31 
 
 
286 aa  359  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.750026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1155  ABC transporter related  72.84 
 
 
256 aa  357  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0959835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3206  ABC transporter related protein  71.49 
 
 
290 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3155  ABC transporter related protein  67.62 
 
 
289 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2891  ABC transporter related protein  69.79 
 
 
284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1185  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  70.64 
 
 
280 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0567598  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1274  ABC transporter related  50 
 
 
237 aa  258  9e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2163  ABC transporter related  51.71 
 
 
276 aa  257  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4895  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
243 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1520  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  49.2 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.235414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  51.5 
 
 
247 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3969  ABC transporter related protein  53.59 
 
 
249 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1421  ABC transporter related  52.59 
 
 
235 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0815  ATPase  52.14 
 
 
243 aa  246  4e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4170  ABC transporter related  51.9 
 
 
245 aa  245  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3930  ABC transporter related  49.36 
 
 
236 aa  241  7.999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0884  ABC transporter-like protein protein  53.02 
 
 
242 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0660  ABC transporter related protein  53.09 
 
 
245 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0924  ABC transporter related  48.33 
 
 
241 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.359133  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1570  ABC transporter related  47.86 
 
 
236 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755782  normal  0.816164 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2925  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.86 
 
 
236 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3135  ABC transporter related  51.29 
 
 
242 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0716  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0745  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  0.759518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3089  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
234 aa  208  9e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1145  ABC transporter related  44.02 
 
 
249 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.457841  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0856  ABC transporter related  47.53 
 
 
233 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2095  ABC transporter related  46.8 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156364  normal  0.0133806 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2917  ABC transporter related  42.98 
 
 
239 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  47.14 
 
 
235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0600  ABC transporter related  47.93 
 
 
234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3960  ABC transporter related  46.64 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4467  ABC transporter related  49.78 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  46.61 
 
 
236 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3396  ABC transporter related  44.07 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0282544 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0464  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
236 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  44.84 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  45.53 
 
 
236 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  46.15 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2654  ABC transporter-like protein  45.11 
 
 
237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00480746  hitchhiker  0.00390953 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3906  ABC transporter related  44.44 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1980  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  45.13 
 
 
240 aa  196  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.681741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0027  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.44 
 
 
254 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  46.98 
 
 
234 aa  195  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1878  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
242 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  44.44 
 
 
235 aa  194  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2709  ABC transporter related  44.44 
 
 
242 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.810827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3361  ABC transporter related  44.44 
 
 
242 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.413712 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0762  ABC transporter-related protein  44.68 
 
 
241 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000284565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4112  high-affinity amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 
233 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0754039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3849  ABC transporter  44.69 
 
 
233 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5351  ABC transporter related  45.3 
 
 
248 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  47.96 
 
 
237 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  45.53 
 
 
246 aa  193  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3169  ABC transporter related  44.49 
 
 
238 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0892288  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  42.06 
 
 
258 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  44.44 
 
 
238 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1826  ABC transporter related  45.11 
 
 
239 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.514017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  43.6 
 
 
253 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1126  putative amino acid ATP-binding ABC transporter protein  45.11 
 
 
237 aa  192  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.577077  normal  0.0994747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1737  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
234 aa  192  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2102  ABC transporter related  43.88 
 
 
265 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3843  ABC transporter related  44.96 
 
 
235 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.434627  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1819  ABC transporter related  44.14 
 
 
253 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2873  ABC transporter related  46.46 
 
 
252 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.296726  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  43.64 
 
 
234 aa  190  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1520  ABC transporter related  42.46 
 
 
270 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1244  ABC transporter-like  45.58 
 
 
233 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3388  ABC transporter related  47.83 
 
 
239 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0490  ABC transporter related  46.61 
 
 
244 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0438645  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4099  ABC transporter related  47.09 
 
 
251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1291  ABC transporter related  43.46 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6245  ABC transporter related  48.26 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.284693  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6414  ABC transporter related  48.26 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0209306  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  45.54 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6647  ABC transporter related  48.26 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146774  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  42.13 
 
 
238 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  42.44 
 
 
239 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
245 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0849  ATPase  41.81 
 
 
231 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
244 aa  189  5e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.75 
 
 
235 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19610  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP binding component  47.03 
 
 
233 aa  188  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0847602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  45.09 
 
 
247 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1507  ABC transporter related  46.15 
 
 
243 aa  188  9e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0092  ABC transporter related  43.33 
 
 
251 aa  187  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.65269  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0266  ABC transporter related  42.62 
 
 
249 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  46.09 
 
 
240 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0063  ABC transporter related  42.31 
 
 
238 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.270537 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.74 
 
 
251 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.760616  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4307  branched-chain amino acid transport protein BraG  44.69 
 
 
233 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  45.05 
 
 
247 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  45.05 
 
 
247 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0310  ABC transporter related  41.7 
 
 
234 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327886  normal  0.481983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0599  ABC transporter related  42.98 
 
 
238 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  45.05 
 
 
247 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.534019 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>