More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1917 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.68 
 
 
638 aa  694    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.15 
 
 
640 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.43 
 
 
637 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50.54 
 
 
647 aa  657    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  49.7 
 
 
666 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.45 
 
 
637 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  53.92 
 
 
644 aa  695    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.68 
 
 
638 aa  694    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.39 
 
 
643 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.96 
 
 
636 aa  747    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.09 
 
 
646 aa  728    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  56.53 
 
 
646 aa  711    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  100 
 
 
664 aa  1342    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.81 
 
 
735 aa  659    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.32 
 
 
638 aa  721    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 
657 aa  700    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.4 
 
 
637 aa  705    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.28 
 
 
636 aa  693    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.02 
 
 
646 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.99 
 
 
638 aa  660    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.09 
 
 
646 aa  657    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.33 
 
 
639 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  55.44 
 
 
648 aa  721    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.66 
 
 
637 aa  666    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.61 
 
 
637 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.02 
 
 
656 aa  694    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  55.69 
 
 
648 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.59 
 
 
636 aa  695    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.68 
 
 
638 aa  693    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.12 
 
 
645 aa  679    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.96 
 
 
657 aa  701    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  56.37 
 
 
646 aa  684    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.53 
 
 
646 aa  665    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  49.63 
 
 
679 aa  689    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.06 
 
 
642 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.86 
 
 
637 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.28 
 
 
636 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.37 
 
 
637 aa  682    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  52.37 
 
 
645 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.13 
 
 
659 aa  687    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.44 
 
 
654 aa  679    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.45 
 
 
637 aa  681    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.19 
 
 
649 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.7 
 
 
652 aa  662    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.11 
 
 
638 aa  657    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.58 
 
 
638 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.28 
 
 
658 aa  683    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.09 
 
 
637 aa  688    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.93 
 
 
672 aa  680    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.66 
 
 
638 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  52.72 
 
 
642 aa  673    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.59 
 
 
662 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.53 
 
 
643 aa  737    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.31 
 
 
646 aa  644    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  49.48 
 
 
667 aa  680    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.33 
 
 
656 aa  698    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  52.19 
 
 
639 aa  632  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.04 
 
 
635 aa  621  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.08 
 
 
638 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.52 
 
 
593 aa  343  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.59 
 
 
597 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.47 
 
 
597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.93 
 
 
585 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.31 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.31 
 
 
597 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.31 
 
 
597 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.31 
 
 
597 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.47 
 
 
597 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.15 
 
 
597 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.15 
 
 
597 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.15 
 
 
597 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.15 
 
 
597 aa  303  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.76 
 
 
578 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.89 
 
 
585 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.82 
 
 
586 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.61 
 
 
625 aa  300  7e-80  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.6 
 
 
585 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.17 
 
 
588 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.24 
 
 
588 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.24 
 
 
588 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  32.48 
 
 
568 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.53 
 
 
575 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.53 
 
 
575 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.25 
 
 
575 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.37 
 
 
584 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.21 
 
 
567 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  31.63 
 
 
584 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.76 
 
 
567 aa  220  7e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  30.43 
 
 
596 aa  217  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  32.13 
 
 
544 aa  216  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483354  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.31 
 
 
662 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1990  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.51 
 
 
609 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.902859  normal  0.104925 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  32.59 
 
 
600 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  29.61 
 
 
601 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0770  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.96 
 
 
593 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.79 
 
 
598 aa  213  1e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.14 
 
 
672 aa  212  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.1 
 
 
567 aa  211  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.51 
 
 
598 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0312  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.28 
 
 
585 aa  211  4e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>