More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0415 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0394  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.56 
 
 		 666 aa  866    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  76.92 
 
 		 663 aa  1093    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0398  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.56 
 
 		 668 aa  865    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3935  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.56 
 
 		 668 aa  858    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0642  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.64 
 
 		 669 aa  848    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0509  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.8 
 
 		 674 aa  852    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.745873  decreased coverage  0.000923774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1777  fumarate reductase flavoprotein subunit  58.07 
 
 		 659 aa  770    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  79.61 
 
 		 662 aa  1124    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0637  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.64 
 
 		 669 aa  848    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.56 
 
 		 668 aa  859    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3750  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.34 
 
 		 669 aa  847    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4114  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.64 
 
 		 674 aa  853    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000002449 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  86.01 
 
 		 672 aa  1201    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1257  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.5 
 
 		 631 aa  697    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2459  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.01 
 
 		 605 aa  693    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1493  fumarate reductase flavoprotein subunit  57.68 
 
 		 667 aa  798    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  76.62 
 
 		 663 aa  1090    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  77.98 
 
 		 668 aa  1108    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3439  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.1 
 
 		 668 aa  853    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3960  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.4 
 
 		 668 aa  857    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0615  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.64 
 
 		 669 aa  848    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3883  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.4 
 
 		 668 aa  856    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0404  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.01 
 
 		 668 aa  865    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3621  fumarate reductase flavoprotein subunit  63.01 
 
 		 668 aa  865    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0457  fumarate reductase flavoprotein subunit  60.27 
 
 		 666 aa  838    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.650499  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0679  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.1 
 
 		 669 aa  853    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  81.61 
 
 		 661 aa  1140    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4076  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.56 
 
 		 668 aa  858    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.212927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1999  fumarate reductase flavoprotein subunit  56.05 
 
 		 619 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000679701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  88.82 
 
 		 662 aa  1237    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0403  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.86 
 
 		 668 aa  867    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  hitchhiker  0.00648266 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  100 
 
 		 662 aa  1375    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1531  fumarate reductase flavoprotein subunit  55.83 
 
 		 618 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.499402  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3220  fumarate reductase flavoprotein subunit  62.1 
 
 		 679 aa  855    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0127  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.23 
 
 		 612 aa  682    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.7734  normal  0.0470081 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1066  fumarate reductase flavoprotein subunit  53.95 
 
 		 614 aa  676    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.191298  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  76.77 
 
 		 663 aa  1092    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3065  fumarate reductase flavoprotein subunit  52.29 
 
 		 619 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1930  fumarate reductase flavoprotein subunit  50.26 
 
 		 595 aa  608  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.61 
 
 		 584 aa  380  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.4 
 
 		 585 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.2 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.84 
 
 		 596 aa  365  2e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.79 
 
 		 605 aa  363  4e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.79 
 
 		 605 aa  362  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.48 
 
 		 596 aa  362  1e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.63 
 
 		 605 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.35 
 
 		 605 aa  360  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.57 
 
 		 566 aa  359  9e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.25 
 
 		 588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.52 
 
 		 596 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.93 
 
 		 596 aa  357  5e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.86 
 
 		 612 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.66 
 
 		 566 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.47 
 
 		 598 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.02 
 
 		 566 aa  354  2.9999999999999997e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.27 
 
 		 581 aa  354  4e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.479481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  35.52 
 
 		 638 aa  352  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  37.11 
 
 		 568 aa  352  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0671  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.53 
 
 		 581 aa  352  2e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.745903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2127  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.59 
 
 		 582 aa  352  2e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.63 
 
 		 611 aa  351  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.1 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.1 
 
 		 595 aa  350  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.13 
 
 		 598 aa  350  5e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.14 
 
 		 579 aa  349  7e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.53 
 
 		 589 aa  349  8e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.53 
 
 		 589 aa  349  8e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.52 
 
 		 575 aa  348  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  36.49 
 
 		 573 aa  346  8e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.32 
 
 		 588 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.39 
 
 		 568 aa  345  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.42 
 
 		 607 aa  345  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.61 
 
 		 612 aa  344  2.9999999999999997e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.74 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.26 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.89 
 
 		 597 aa  343  7e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.02 
 
 		 588 aa  342  9e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.71 
 
 		 567 aa  342  2e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.15 
 
 		 604 aa  342  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.36 
 
 		 596 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.54 
 
 		 588 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.54 
 
 		 588 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.74 
 
 		 577 aa  340  4e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.61 
 
 		 595 aa  340  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.67 
 
 		 608 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.02 
 
 		 567 aa  340  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.11 
 
 		 604 aa  340  5e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.19 
 
 		 588 aa  340  5e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.54 
 
 		 588 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.7 
 
 		 607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.3 
 
 		 588 aa  340  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.93 
 
 		 608 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.63 
 
 		 575 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.37 
 
 		 588 aa  339  8e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  34.54 
 
 		 596 aa  339  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.74 
 
 		 607 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66251  succinate dehydrogenase  36.58 
 
 		 641 aa  338  1.9999999999999998e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.36 
 
 		 617 aa  338  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>