More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3256 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  72.27 
 
 		 642 aa  947    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.64 
 
 		 637 aa  1080    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.23 
 
 		 647 aa  854    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  90.6 
 
 		 638 aa  1170    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.34 
 
 		 654 aa  884    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.35 
 
 		 643 aa  897    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.72 
 
 		 649 aa  883    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.71 
 
 		 636 aa  874    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  69.59 
 
 		 646 aa  898    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.18 
 
 		 656 aa  901    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73 
 
 		 657 aa  939    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.02 
 
 		 646 aa  919    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  69.7 
 
 		 644 aa  919    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.17 
 
 		 637 aa  1089    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.87 
 
 		 636 aa  800    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.8 
 
 		 637 aa  1004    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.76 
 
 		 646 aa  810    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 		 638 aa  756    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.27 
 
 		 646 aa  869    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.73 
 
 		 646 aa  820    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.17 
 
 		 639 aa  749    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.27 
 
 		 637 aa  1087    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.96 
 
 		 666 aa  887    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.65 
 
 		 638 aa  698    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.84 
 
 		 635 aa  758    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.73 
 
 		 657 aa  847    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.87 
 
 		 636 aa  878    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.8 
 
 		 638 aa  1119    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.03 
 
 		 636 aa  879    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.55 
 
 		 645 aa  873    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 638 aa  1330    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  63.31 
 
 		 667 aa  891    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 679 aa  883    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  52.66 
 
 		 664 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.23 
 
 		 646 aa  841    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.98 
 
 		 659 aa  854    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.49 
 
 		 652 aa  917    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.35 
 
 		 662 aa  857    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  67.4 
 
 		 648 aa  875    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.53 
 
 		 637 aa  932    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  68.76 
 
 		 648 aa  897    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  67.75 
 
 		 645 aa  892    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.85 
 
 		 637 aa  898    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.33 
 
 		 638 aa  1113    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.19 
 
 		 643 aa  895    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.33 
 
 		 638 aa  1113    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.02 
 
 		 640 aa  904    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.56 
 
 		 638 aa  803    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  60.03 
 
 		 639 aa  771    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  90.3 
 
 		 638 aa  1151    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.76 
 
 		 658 aa  854    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.16 
 
 		 637 aa  915    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.99 
 
 		 672 aa  865    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.22 
 
 		 637 aa  904    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.17 
 
 		 637 aa  1089    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  67.3 
 
 		 646 aa  847    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.77 
 
 		 735 aa  882    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.7 
 
 		 642 aa  891    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.13 
 
 		 656 aa  909    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.59 
 
 		 593 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  347  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.07 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.9 
 
 		 597 aa  343  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.53 
 
 		 585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.81 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.53 
 
 		 585 aa  328  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.02 
 
 		 588 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.57 
 
 		 585 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.98 
 
 		 625 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.25 
 
 		 578 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  30.93 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.22 
 
 		 598 aa  228  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.74 
 
 		 575 aa  220  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.68 
 
 		 575 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.68 
 
 		 575 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.52 
 
 		 566 aa  215  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.78 
 
 		 598 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.27 
 
 		 566 aa  213  7.999999999999999e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  29.83 
 
 		 596 aa  213  9e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.73 
 
 		 598 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.42 
 
 		 606 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.91 
 
 		 598 aa  210  7e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.45 
 
 		 578 aa  209  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.25 
 
 		 567 aa  209  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  31.01 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.55 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.9 
 
 		 617 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  28.25 
 
 		 599 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3128  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.28 
 
 		 610 aa  208  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0343  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.73 
 
 		 596 aa  209  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.891485  unclonable  0.00000264119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>