More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2933 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.54 
 
 
654 aa  876    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  86.68 
 
 
637 aa  1112    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.07 
 
 
647 aa  846    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  72.27 
 
 
642 aa  947    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  60.97 
 
 
639 aa  775    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71 
 
 
636 aa  900    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.19 
 
 
636 aa  795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.38 
 
 
656 aa  912    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.06 
 
 
646 aa  933    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.03 
 
 
646 aa  847    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  68.65 
 
 
648 aa  886    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  86.05 
 
 
637 aa  1111    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.61 
 
 
646 aa  818    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.47 
 
 
637 aa  1039    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  69.86 
 
 
648 aa  902    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.2 
 
 
646 aa  795    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.8 
 
 
638 aa  772    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.8 
 
 
638 aa  1094    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.11 
 
 
646 aa  796    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.95 
 
 
639 aa  745    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.27 
 
 
637 aa  1094    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
666 aa  870    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  68.37 
 
 
645 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.34 
 
 
635 aa  779    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.32 
 
 
636 aa  909    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
638 aa  1327    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  53.68 
 
 
664 aa  673    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.5 
 
 
645 aa  878    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.47 
 
 
637 aa  912    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.89 
 
 
637 aa  1111    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.29 
 
 
659 aa  845    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.2 
 
 
662 aa  849    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.13 
 
 
657 aa  842    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.39 
 
 
649 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  71.47 
 
 
646 aa  904    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.85 
 
 
637 aa  920    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.65 
 
 
637 aa  894    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.94 
 
 
637 aa  923    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.78 
 
 
657 aa  932    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.89 
 
 
652 aa  932    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  98.59 
 
 
638 aa  1307    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.07 
 
 
643 aa  915    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.6 
 
 
656 aa  906    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.38 
 
 
638 aa  710    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  83.1 
 
 
638 aa  1075    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.79 
 
 
658 aa  836    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.72 
 
 
638 aa  805    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.8 
 
 
642 aa  895    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.61 
 
 
672 aa  869    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.92 
 
 
643 aa  913    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  70.64 
 
 
644 aa  922    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  83.39 
 
 
638 aa  1083    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  98.59 
 
 
638 aa  1307    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  61.8 
 
 
667 aa  861    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.77 
 
 
735 aa  877    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.64 
 
 
640 aa  907    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  69.03 
 
 
646 aa  861    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.32 
 
 
636 aa  905    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.1 
 
 
679 aa  864    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.19 
 
 
593 aa  359  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.89 
 
 
597 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.89 
 
 
597 aa  342  9e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.73 
 
 
597 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.73 
 
 
597 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.73 
 
 
597 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.73 
 
 
597 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.73 
 
 
597 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.56 
 
 
597 aa  342  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.56 
 
 
597 aa  341  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.56 
 
 
597 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.56 
 
 
597 aa  340  7e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.67 
 
 
585 aa  329  7e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.74 
 
 
586 aa  324  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.35 
 
 
585 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 
585 aa  323  7e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.61 
 
 
625 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.62 
 
 
588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 
588 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.23 
 
 
588 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.17 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  31.77 
 
 
568 aa  228  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.39 
 
 
598 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  31.44 
 
 
566 aa  223  8e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.14 
 
 
566 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.86 
 
 
606 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.86 
 
 
599 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  29.22 
 
 
575 aa  214  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.87 
 
 
568 aa  212  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3936  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.24 
 
 
598 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.71 
 
 
592 aa  210  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.21 
 
 
598 aa  209  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  30.41 
 
 
596 aa  209  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.65 
 
 
598 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.97 
 
 
662 aa  209  1e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.55 
 
 
592 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.53 
 
 
592 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.47 
 
 
617 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.55 
 
 
592 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.55 
 
 
592 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.07 
 
 
598 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>