More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0676 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.39 
 
 
679 aa  1130    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  65.77 
 
 
648 aa  892    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.66 
 
 
637 aa  841    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.77 
 
 
647 aa  957    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.75 
 
 
654 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
637 aa  834    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.92 
 
 
637 aa  885    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  65.07 
 
 
642 aa  868    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.91 
 
 
643 aa  875    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.82 
 
 
646 aa  902    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.71 
 
 
636 aa  833    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.1 
 
 
657 aa  1002    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.21 
 
 
637 aa  868    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.81 
 
 
643 aa  880    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.27 
 
 
646 aa  885    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.04 
 
 
638 aa  758    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.77 
 
 
646 aa  918    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 
639 aa  729    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.16 
 
 
638 aa  827    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.06 
 
 
637 aa  836    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.98 
 
 
646 aa  937    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.52 
 
 
635 aa  754    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  65.31 
 
 
646 aa  880    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.26 
 
 
636 aa  824    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
638 aa  859    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.34 
 
 
659 aa  991    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.63 
 
 
645 aa  812    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.26 
 
 
637 aa  858    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.96 
 
 
638 aa  851    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.4 
 
 
644 aa  852    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.21 
 
 
656 aa  872    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.36 
 
 
637 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
666 aa  1380    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.27 
 
 
642 aa  886    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  60.06 
 
 
639 aa  785    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.31 
 
 
637 aa  933    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.61 
 
 
638 aa  850    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.41 
 
 
636 aa  829    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.51 
 
 
656 aa  877    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.61 
 
 
638 aa  850    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.12 
 
 
646 aa  927    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.06 
 
 
637 aa  829    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  69.67 
 
 
645 aa  941    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.16 
 
 
735 aa  854    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.26 
 
 
638 aa  845    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.72 
 
 
658 aa  933    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.59 
 
 
662 aa  982    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.67 
 
 
672 aa  867    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  49.7 
 
 
664 aa  646    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.96 
 
 
657 aa  890    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.1 
 
 
652 aa  867    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.88 
 
 
638 aa  842    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.61 
 
 
640 aa  853    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.1 
 
 
648 aa  848    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  81.17 
 
 
667 aa  1143    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.73 
 
 
636 aa  813    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  62.99 
 
 
646 aa  833    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.84 
 
 
649 aa  868    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.54 
 
 
638 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.15 
 
 
597 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
597 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.88 
 
 
597 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.88 
 
 
597 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
597 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
597 aa  336  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
597 aa  335  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
597 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
597 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.72 
 
 
597 aa  335  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.66 
 
 
597 aa  333  5e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.69 
 
 
593 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.36 
 
 
586 aa  329  9e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.91 
 
 
585 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.02 
 
 
625 aa  320  6e-86  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.21 
 
 
585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 
585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.11 
 
 
588 aa  311  2e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.96 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.96 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.23 
 
 
578 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  29.11 
 
 
568 aa  214  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.62 
 
 
672 aa  209  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.83 
 
 
662 aa  204  5e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  30.73 
 
 
662 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.24 
 
 
661 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.43 
 
 
663 aa  200  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  28.93 
 
 
585 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.9 
 
 
575 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.27 
 
 
663 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  31 
 
 
663 aa  197  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  27.11 
 
 
570 aa  196  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0334  fumarate reductase flavoprotein subunit  31.28 
 
 
668 aa  196  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3128  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.95 
 
 
610 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  28.9 
 
 
584 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.6 
 
 
567 aa  195  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.5 
 
 
575 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.5 
 
 
575 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0857  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.37 
 
 
662 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3758  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.32 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.5 
 
 
542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>