More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3970 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3019  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.05 
 
 		 638 aa  865    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.07389  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1917  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  51.59 
 
 		 664 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.030086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1177  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.3 
 
 		 637 aa  856    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0271932  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1615  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.57 
 
 		 647 aa  899    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0211  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.24 
 
 		 659 aa  1086    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.24526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5261  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 639 aa  840    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1556  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.91 
 
 		 637 aa  870    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.75468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2852  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.12 
 
 		 646 aa  905    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1706  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.8 
 
 		 643 aa  904    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0241  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.19 
 
 		 679 aa  988    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.588419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0985  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.91 
 
 		 652 aa  872    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.831931  normal  0.817147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2399  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.33 
 
 		 656 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2452  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.6 
 
 		 646 aa  911    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1733  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.84 
 
 		 637 aa  909    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2818  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.14 
 
 		 636 aa  855    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8457  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.5 
 
 		 642 aa  876    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6535  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.27 
 
 		 657 aa  1089    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.326104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.88 
 
 		 638 aa  833    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000706874  normal  0.0228464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0445  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.45 
 
 		 637 aa  881    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000586543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3080  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.17 
 
 		 656 aa  890    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0385  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.12 
 
 		 649 aa  878    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.342601  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2081  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.32 
 
 		 646 aa  870    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0585  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.79 
 
 		 638 aa  778    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.755326  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1934  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.72 
 
 		 646 aa  892    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2087  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.03 
 
 		 639 aa  741    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2396  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.23 
 
 		 637 aa  840    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000124649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5880  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  65.31 
 
 		 642 aa  878    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0917761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 662 aa  1380    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755749  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0641  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.28 
 
 		 635 aa  815    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.889552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2637  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.69 
 
 		 636 aa  847    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2933  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.2 
 
 		 638 aa  867    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2442  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.82 
 
 		 646 aa  915    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3466  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.05 
 
 		 645 aa  822    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2723  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.45 
 
 		 636 aa  859    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3256  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.05 
 
 		 638 aa  849    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000224901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23330  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.82 
 
 		 735 aa  880    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2603  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.25 
 
 		 637 aa  847    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2213  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.5 
 
 		 638 aa  843    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00041911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5227  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  63.91 
 
 		 646 aa  848    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1709  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.11 
 
 		 643 aa  910    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0636844  normal  0.274652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2473  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.93 
 
 		 637 aa  949    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0913  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.3 
 
 		 637 aa  846    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.27671e-31 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1277  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.66 
 
 		 654 aa  841    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157042  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2452  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  65.3 
 
 		 644 aa  866    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3922  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  66.92 
 
 		 648 aa  905    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1122  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  67.84 
 
 		 646 aa  897    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1053  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  65.65 
 
 		 648 aa  878    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0670  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.36 
 
 		 640 aa  868    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5010  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  69.67 
 
 		 645 aa  927    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.82 
 
 		 636 aa  822    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3126  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.05 
 
 		 638 aa  865    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.940484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2482  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.57 
 
 		 638 aa  859    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00128  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0101  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.82 
 
 		 658 aa  921    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3552  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.36 
 
 		 672 aa  863    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04695  succinate dehydrogenase  71.17 
 
 		 667 aa  1002    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1577  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.2 
 
 		 657 aa  919    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0114016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0676  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.59 
 
 		 666 aa  1009    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3333  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.3 
 
 		 637 aa  845    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000650978  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.73 
 
 		 638 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.555604 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1862  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.62 
 
 		 586 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4413  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.630404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4252  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4754  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4629  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 		 597 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0610  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 		 597 aa  346  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4264  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.41034  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.82 
 
 		 597 aa  345  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4644  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4645  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4625  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.89 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2571  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.63 
 
 		 593 aa  343  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 		 597 aa  343  7e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2606  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.57 
 
 		 585 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000856903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1207  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.91 
 
 		 588 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1229  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.91 
 
 		 588 aa  340  4e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.57 
 
 		 585 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.59 
 
 		 585 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000746215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0731  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.37 
 
 		 588 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306166  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0744  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.82 
 
 		 578 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000832162  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  33.93 
 
 		 625 aa  308  3e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  30.23 
 
 		 568 aa  235  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0425  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.95 
 
 		 672 aa  211  4e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2205  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.87 
 
 		 662 aa  209  2e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0635  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.74 
 
 		 566 aa  208  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0393941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0395  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.68 
 
 		 661 aa  207  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000651077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.95 
 
 		 575 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  30.15 
 
 		 584 aa  204  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0415  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.3 
 
 		 662 aa  204  5e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00858374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0471  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 598 aa  204  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0382  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.14 
 
 		 598 aa  203  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.98 
 
 		 575 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0458  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.47 
 
 		 663 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.71 
 
 		 617 aa  201  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0433  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.63 
 
 		 663 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1548  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.47 
 
 		 663 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5672  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 602 aa  201  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.140483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3836  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3856  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03988  hypothetical protein  28.62 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4713  fumarate reductase flavoprotein subunit  28.62 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>